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由bgi领导的团队提出的非人类灵长类动物单细胞转录组图谱

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深圳华大基因和亚洲、欧洲和美国的其他研究中心的研究人员已经开发出一种单细胞转录组图谱,涵盖了一种非人灵长类动物的几十种成年组织类型猕猴属fascicularis通常被称为食蟹猴、食蟹猴或长尾猴。

这是第一项展示非人类灵长类动物细胞图谱的研究,”bgi深圳深圳湾实验室和郑州大学的研究员刘龙奇在一封电子邮件中说,并补充说,这项工作“将有助于加快对人类疾病和药物筛选的理解,以及药物的临床前试验。”

当他们报道自然周三,研究人员与华大基因进行了单核RNA测序和/或单细胞RNA测序DNBelab C4单细胞库平台从45m . fascicularis纸巾,代表五名男性和三名女性m . fascicularis猴子。Liu说,与早期在小鼠或人类中产生的单细胞表达图谱所描述的器官集合相比,由此产生的集合标志着更广泛的器官集合,同时提供了增强的基因捕获和减少细胞类型偏差。

该团队利用这些收集的数据开始探索从细胞-细胞相互作用和相关信号模式到测试组织中的病毒受体位点的一切。例如,在Wnt信号分析的同时,研究人员深入研究了ACE2和TMPRSS2受体高表达细胞的共表达模式,SARS-CoV-2蛋白利用这些受体访问宿主细胞。

作者解释说:“除了ACE2和TMPRSS2,还有许多其他分子参与了促进SARS-CoV-2结合到细胞表面或在COVID-19的发病机制中。”他们补充说,可以在非人类灵长类动物细胞图谱(NHPCA)网站上研究“它们在猴子组织中的表达或共同表达、其他联系、病毒与宿主的相互作用以及物种间的差异”。

该团队解释说,通过对食蟹猴人类基因的同源分析,跨组织转录组也为人类传染病易感性和遗传疾病提供了线索。

作者总结道:“未来,NHPCA数据库将扩展额外的组学层和来自疾病建模研究和衰老的数据集。”“这也将与比较我们的m . fascicularis未来的细胞图谱,来自人类和其他非濒危[非人类灵长类]。总之,这些信息将有助于提高对灵长类动物的认识。”

作者注意到,新生成的m . fascicularis为人类和其他非人类灵长类动物生成的细胞图谱和类似数据集可能有助于理解灵长类动物的生物学和进化,例如,包括人类特征的出现。

“我们相信,在细胞水平上进行物种间的系统比较,对于理解生命和我们自己物种的复杂性非常重要,”刘说,“特别是器官在漫长的进化史中是如何进化的,以及为什么不同物种之间的器官结构和功能不同。”

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