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瑞典Aplex Bio公司准备推出“hyperplex”PCR平台

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纽约- Aplex Bio本周宣布已筹集1400万瑞典克朗(150万美元),以支持其基于“聚合酶链反应”的分子检测平台的开发和推出。

这家成立两年的瑞典公司,总部设在斯德哥尔摩卡罗林斯卡学院,相信其技术具有灵敏度、特异性和规模,可以挑战数字PCR和下一代基于测序的应用。vwin德赢ac米兰合作

首席执行vwin德赢ac米兰合作官Umear Naseem表示,这项技术最终可能被用于病原体检测和癌症诊断,包括伴生诊断。Aplex Bio目前正在吸引众多首批采用者参加一项将于第二季度开始的早期试用计划。

Naseem说:“我们正在研究哪些客户可以接受,因为我们希望在不同的应用中有一些关键的意见领袖。”“我们正在与癌症诊断和其他应用领域的不同参与者进行谈判。”

Naseem在提供名为Theta的测序平台的Single Technologies公司工作了三年之后,于2020年创立了Aplex Bio,最近担任化学和材料总监。在此之前,他在瑞典隆德的Sol Voltaics担任职务,该公司专注于将纳米材料应用于太阳能。他的科学背景是化学工程。

在他开发Aplex技术的过程中,瑞典国家研究中心——科学实验室(sciilifevwin德赢ac米兰合作lab)的马茨·尼尔森(Mats Nilsson)实验室一直是他的合作伙伴。尼尔森实验室多年来一直是多路复用和测序方法的创新中心,负责HaloPlex背后的挂锁探针技术,例如,现在由安捷伦技术公司商业化。vwin德赢ac米兰合作

Naseem表示,虽然Aplex Bio的核心超探针技术是在公司内部开发的,但该公司“几乎立即”启动了vwin德赢ac米兰合作与sciilifelab的合作,将该技术用于挂锁探针滚动圈扩增分析,以及用于空间生物学研究。

他指出,Aplex也在与尼尔森实验室合作研究终端用户应用。

Aplex Bio尚未公布其技术,但Naseem愿意透露一些细节。vwin德赢ac米兰合作目前,该公司可以分析玻璃表面沉积的100多个生物分子,这些分子可以用传统的荧光图像检测阅读器读取。Nasevwin德赢ac米兰合作em称,这项技术可以产生100种合成颜色,并在一个步骤中高质量地读出它们。他坚持认为,这些能力自然有助于实现多路复用,并可能为“全新的分子技术兵工厂”提供力量。

Aplex Bio的方法将挂锁探针的单核苷酸特异性与单分子敏感性和高多样性结合起来。Naseem说:“这基本上优于数字PCR。”“这是下一代PCR技术,我们称之为数字PCR之外的技术。”vwin德赢ac米兰合作

在某些情vwin德赢ac米兰合作况下,该技术还可以用来代替测序,Naseem表示,测序在成本、交货期和资源方面存在缺陷。Naseem说:“测序永远不会在成本上与多路复用竞争,即使其中一个将样本集中在一起。”“这是不可避免的,因为测序涉及多个步骤,而这里唯一的消耗品是一个玻璃载玻片,”他说。“剩下的就是塑料管和生物化学。”

Naseem指出,对于那些熟悉微阵列技术的人来说,Aplex的产品可以被认为是自组装阵列。vwin德赢ac米兰合作每一滴放在载玻片上的液滴都可能是一个样本或一个病人,因此,举例来说,你可以使用Aplex Bio的方法在同一表面上对100多个目标进行100多个样本或病人的检测,而不是用一个病人的样本对整个基因组阵列进行检测。

Naseem说:“突然之间,我们就可以进行大规模的高通量检测筛选。”他说,例如,该技术可以应用于96井vwin德赢ac米兰合作或384井板,Aplex将与合作伙伴合作,在未来几年开发一种自动化解决方案。他说,一种自动化的方法有望在2024年投入市场。

除了病原体诊断、癌症诊断、抗菌素耐药性测试和环境监测之外,Aplex Bio还设想将其技术应用于伴生诊断。vwin德赢ac米兰合作

Naseem说:“这是因为我们达到了一个独特的甜蜜点,能够在一步中分析大约100个生物标志物。”他说:“这比测序更具成本效益和可扩展性,使我们的技术在治疗复杂疾病患者之前可以像PCR测试一样使用。”vwin德赢ac米兰合作

废水检测

一个最初的合作者是瑞典环境流行病学中心,它是科学实验室内的一个环境测试单位。SEEC是在当前的COVID-19大流行期间成立的,是科学实验室大流行实验室防范计划的一部分。该委员会持续对瑞典废水进行分析,以监测SARS-CoV-2的传播——这一应用已经在进行被证明是甜点用于数字PCR

sciilifelab的病毒学家Maja Malmberg与SEEC合作,他表示,该中心一直在废水监测工作中使用定量PCR,但最近决定在一项试点研究中尝试使用Aplex Bio平台,看看它是否可以在相同的检测方法中从废水中检测出额外的病原体,并寻找感兴趣的SARS-CoV-2变体。

虽然该项目还处于初期阶段,Malmberg说她的团队已经对Aplex Bio的技术有了“非常积极的体验”。vwin德赢ac米兰合作最初的试验集中在Aplex平台检测废水中SARS-CoV-2的能力,病毒存在不同水平。现在,合作伙伴正致力于检测特定的变异,着眼于在同一样本中实现不同病毒的多路复用。

Malmberg说:“我认为这在低收入国家或有更多病原体、不太可能为许多不同的东西运行大量pcr的地方会非常有用。”

Malmberg指出,废水是一种“自然聚集的样本”,这意味着检测废水比检测个人病毒要便宜。她说:“如果你还可以多重处理,在一个样本中处理50或100个目标,如果它真的起作用,它的潜力是令人兴奋的。”

Naseem说,这次合作可以展示Aplex Bio平台检测PCR无法检测到的突变的能力,同时克服测序固有的敏感性问题。

Naseem说:“通过我们的解决方案,它们可以获得高灵敏度,并可以进行点突变检测。”他证实,Aplex将继续与联办合作,在其平台上检测更多的病原体。

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