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自身免疫性疾病风险与转录因子结合的遗传变异相关

一项新的研究发现,纽约 - 影响特定转录因子的能力的遗传变异,影响特定转录因子在中性粒细胞中结合DNA的能力可能会影响易感性。

中性粒细胞构成大部分白细胞群,并且是炎症和高度细胞毒性细胞。作为它们在免疫系统中作用的副作用,他们被认为有助于炎症和自身免疫疾病。

在一个新的出现研究自然通信,研究人员国际团队与先前收集的基因组关联研究数据合并了中性粒细胞的功能分析。他们发现影响母转录因子Pu.1与结合DNA的能力的遗传变化可能影响自身免疫疾病风险,并发现可能涉及的十几种基因。

“如果我们要充分了解[基因变异]对疾病的影响,”在巴塞罗那的Josep carreras Leukemia研究院的团队领导者的Co-Searia Biola-Maria Javierre,就是了解细胞中的机制至关重要在一份声明中。“在这种情况下,遗传变异如何影响pu.1结合的能力,这对中性粒细胞中的基因表达进行了调节,可能对理解中性粒细胞在某些自身免疫疾病中起作用的作用至关重要。”

使用来自蓝图项目的芯片SEQ数据 - 一种研究,该研究检查了血细胞的变化以及它是否影响了心脏病和类风湿性关节炎和哮喘等自身免疫疾病的复杂疾病风险 - 研究人员产生了PU.1结合的地图集。已知PU.1会影响骨髓素发育并结合骨髓细胞中的许多增强子元素,其在小鼠中性粒细胞中的损失导致感染后的高炎症表型。

基于近100个个人的群体内的共同遗传变异,研究人员开始通过鉴定定量特性基因座来探讨PU.1的遗传影响。

研究人员指出,这些PU.1 TFQTLs与局部染色质国家有关。他们补充说,影响PU.1的变体和活性H3K4ME组蛋白标记往上处于相同的方向,而它们通常呈PU.1的相反方向,并且抑制M3K27ME3标记,这与PU的激活作用一致。1。然而,偶尔,PU.1和压抑M3K27ME3标记具有类似的效果,表明它也可能用作阻遏物。

与此同时,使用来自英国Biobank和其他研究的数据,研究人员指出,PU.1 TFQTLS富集与细胞计数等骨髓骨质的关联以及类似草脂,哮喘,类风湿性关节炎等自身免疫和炎症性疾病。和溃疡性结肠炎。

通过进一步结合促进剂捕获中性粒细胞中的HI-C和EQTL数据,研究人员寻找这些PU.1疾病协会背后的潜在目标基因。通过这一点,它们确定了27个高置信靶基因。例如,它们在RNASET2基因上归零,该基因先前已与IBD相关联,以及PLCL1基因座,其包括先前与克罗恩病,狼疮和过敏症等疾病相关的多种变体。

研究人员与其他结果结合在其他结果中,中性粒细胞调解了自身免疫反应,他们的研究结果表明,在某些情况下,他们甚至可能在某些情况下具有司机角色。

“这样的研究如此与功能分析集成了大规模的遗传研究为我们提供了我们的基本数据,了解我们对人类基因组和表观群组合的差异相互作用的理解,这是一位高级员工科学家斯蒂芬瓦特的第一作者斯蒂芬瓦特惠康信托桑格研究所在一份声明中表示。“通过进一步研究建立这种理解将有助于通知新的途径来治疗这些条件。”

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