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全基因组测序发现与严重COVID-19相关的新的宿主遗传变异

SARS-CoV-2 SEM NIAID

纽约-研究人员已经发现了其他的宿主遗传变异,这些变异使个人容易患上严重的COVID-19。

全球重症监护死亡率遗传学(genome icc)联盟的研究人员在对约7500名重症COVID-19患者和4.8万多名对照组进行分析时,发现并复制了近24个与严重COVID-19易感性有关的基因座,发表在自然周一.这些变异包括16个新的关联,并强调了干扰素信号通路和其他过程在疾病严重性中的作用。他们还指出了治疗严重COVID-19的可能治疗靶点,这在一定程度上是由于人们自身的免疫反应。

“基因组icc背后的想法是,只要我们足够了解这一过程,我们就可以找到药物,阻止免疫系统对器官造成损害,而不会完全关闭免疫系统,导致感染流行。”爱丁堡大学重症监护医学顾问、资深作者肯尼斯·贝利在一场新闻发布会上说。

基因组icc联盟成立于2015年,旨在研究影响传染病结局的遗传因素,此前对严重COVID-19进行了基于微阵列的全基因组关联分析。该分析报告在自然在2020年,涉及基因参与了严重COVID-19风险中的抗病毒和炎症免疫反应。

在他们的新分析中,研究人员对来自英国224个重症监护室的7491名COVID-19危重患者进行了全基因组测序,他们与48400名对照组进行了比较,包括来自10万基因组计划的参与者和轻度COVID-19患者。

通过这种方法,研究人员通过欧洲血统队列中个体的GWAS定位了22个与严重疾病相关的信号,以及来自多血统meta分析的另外3个独立信号。他们对9937名住院的COVID-19患者和来自英国生物库、AncestryDNA、宾夕法尼亚医学生物库和盖辛格卫生系统的100万对照进行了第二次分析,进一步复制了这25个信号中的23个。

在这些信号中,有16个是新的基因关联。其中包括IFNA10和PLSCR1的变体,它们参与干扰素的信号传递,干扰素是一种通常由免疫细胞释放的蛋白质,用于对抗病毒入侵者。Baillie认为,IFNA10中的错义变体可能会导致其编码的蛋白质发生错误折叠,从而影响其信号传递能力。

其他新的联系可以追溯到白细胞分化基因BCL11A和血型抗原分泌状态基因FUT2。先前的研究已经建议之间的关系土著居民的血型以及COVID-19的易感性和严重性,包括上周发表的一项涉及9号染色体ABO基因的研究。

研究人员进一步在两种疾病相关组织,肺和全血中进行了转录组范围的关联研究。这项分析发现了表达与COVID-19严重程度有关的基因,例如黏液蛋白生产基因MUC1表达增加与严重疾病之间的联系。

孟德尔随机化分析还发现髓细胞黏附分子SELE、ICAM5和CD209以及凝血因子F8是因果关系,并提示凝血因子和血小板激活在严重COVID-19风险中的作用。

研究人员指出,这些变异中的许多都可能成为治疗靶点。

Baillie在简报中补充说,他们之前的研究发现TYK2与严重的COVID-19有关,而TYK2是JAK抑制剂baricitinib的一个靶点。部分基于这一发现,baricitinib被纳入了COVID-19治疗的随机评估(RECOVERY)试验,该试验上周报告称baricitinib是一种对严重COVID-19的有效治疗方法。

拜利说:“我认为这证明了,正如我所希望的那样,你可以利用遗传学找到新的治疗方法。”

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