纽约——新的研究表明，肺样本中的微生物群落和宿主基因表达特征可能为接受健康供体骨髓移植的儿童的肺功能特征提供治疗前的线索。
“儿童异基因造血细胞移植(HCT)后，基线肺功能受损与死亡率相关，但对移植前肺功能的分子通路的认识有限，阻碍了肺靶向干预的发展。”加州大学旧金山分校和陈-扎克伯格生物中心的研究员Joseph DeRisi，康奈尔大学和纪念斯隆-凯特琳癌症中心的Jaap Boelens和他们的同事解释道。
当他们报道在科学转化医学周三，研究人员使用了转转录组RNA测序，对荷兰104名儿童在接受异基因HCT治疗前的大约一两周内收集的支气管肺泡灌洗样本中的微生物组和宿主基因表达特征进行了分析，并将这些模式与匹配的肺功能测试结果进行了比较。
在54名表现出肺限制、氧弥散障碍、肺活量或其他肺部功能改变(基于全球肺指数临界值)迹象的儿童中，研究小组发现葡萄球菌以及其他与皮肤或鼻腔通道相关的微生物，但共生微生物的含量低于通常水平，通常在喉咙的声门上区检测到。
研究人员报告说，治疗前肺部变化的存在也与HCT后较差的结果相对应，包括全因死亡率和肺损伤的上升。通过引入来自支气管肺泡灌洗样本的基因表达数据——以及来自人类肺细胞图谱等资源的细胞类型特异性标记的现有洞察——他们跟踪了肺功能改变儿童的细胞和分子转移。
作者写道:“我们发现，在准备接受异基因HCT的儿童中，[肺功能检测]异常是常见的，主要包括限制和扩散障碍。”“异常与肺微生物组衰竭、原纤维化信号转导和hct后死亡率有关。”
研究小组解释说，特别是宿主基因表达数据表明免疫活性降低，肺泡上皮通路激活，以及所谓的上皮到间质转变特征。总之，这些发现指出了微生物群落特征的改变、肺纤维化和肺泡损伤之间的潜在联系。肺泡损伤是肺部用来从流经肺部的血液中将氧气转换为二氧化碳的。
作者建议:“[支气管肺泡灌洗]中微生物缺失和异常上皮基因表达的检测增强了hct前肺功能检测对hct后死亡率结局的预后效用。”“这些发现表明，在hct前肺功能障碍的发病机制中，微生物群衰竭、肺泡损伤和肺纤维化之间存在潜在的可操作联系。”