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康奈尔大学分拆Inso生物科学公司在长读测序样品准备中看到机会

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来自康奈尔大学的研究人员,包括太平洋生物科学公司的联合创始人、名誉教授哈罗德·克雷格黑德,已经启动了一家初创公司,将他们开发并申请专利的核酸提取和样品准备技术商业化。vwin德赢ac米兰合作

目前位于纽约伊萨卡的Inso生物科学公司将DNA提取和样品制备作为其首个应用。但这只是这项从康奈尔大学获得许可的技术的潜在应用之一,它使用物理而不是化学来获取DNA。vwin德赢ac米兰合作

“我们可以在30到40分钟内完成样品处理,而不是4到6小时,”Inso首席执行官兼联合创始人Harvey Tian表示,时间缩短了10倍。他补充说,这是长度为40kb到50kb的DNA片段,但它们可以长到100kb。此外,该公司的方法将DNA保持在溶液中,这比基于化学结合的方法对DNA的损害更小。田说,该公司可以成功地为Illumina、PacBio和牛津纳米孔技术公司的测序仪制备样品。

2048 Ventures的负责人朱莉·沃尔夫(Julie Wolf)说,Inso是测序样本准备市场上“新浪潮初创公司”的一部分,这些公司正在为一些研究人员的瓶颈提供技术解决方案。2048 Ventures领导了该公司220万美元的投资种子前融资轮.“如果你与核心(实验室)主任交谈,你会发现这是一个非常棘手的问题,即使在学术层面也是如此。”

“高分子量DNA提取是一项需要精细调整和工作的任务,”威斯康星大学生物技术中心DNA测序设施的实验室经理莫莉·泽勒(Molly Zeller)说。vwin德赢ac米兰合作“但一旦你弄清楚样本类型的差异,这个过程就会相当顺利。”

Wolf说,但是长读测序要走向临床,该领域必须找到一种方法来减少样品准备所需的时间。

印索的故事开始于克雷格黑德的康奈尔实验室。在开发了支撑PacBio单分子实时长读测序平台的半导体处理和光子学技术后,他将注意力转向了他认为可以增强新兴测序市场的上vwin德赢ac米兰合作游技术。

克雷黑德是一名训练有素的物理学家,在转向生物学之前曾在半导体行业工作。他说,他追求的是新的机械方法来制备样品,而不是进一步发展基于化学结合的分析方法,比如磁珠。

Inso的实现技术是一个充vwin德赢ac米兰合作满小柱阵列的微流体通道。它类似于弹簧弹子板,柱子之间的空间随着样品进入通道的深入而逐渐减小。当生物物质流过时,这些柱状物会阻挡生物物质,并捕捉细胞或细胞核,而更小的物体(也可以收集和分析)则会穿过。裂解后,染色体DNA本身就像叉子上的意大利面一样缠在柱子上。

田是克雷黑德实验室最后一名毕业的学生,他发表了关于柱状阵列技术的博士论文,受到实验室历史和如果不尝试商业化这项技术“将陷入黑暗”的担忧的启发,走上了创业之路。vwin德赢ac米兰合作

到目前为止,这家公司规模很小,只有三名员工,其中包括田先生在内的两名全职员工,但他希望到今年年底,员工人数能翻一番。

直到最近,该公司的资金主要来自政府拨款。该公司于2021年从美国国立卫生研究院获得了25万美元的小企业创新研究第一阶段拨款,用于探索结核病诊断的样本处理和22.5万美元的拨款SBIR第一阶段批准此外,Inso最近完成了一个加速器项目IndieBio在那里,沃尔夫第一次遇到了这家公司。

她说:“总的来说,我们非常喜欢自动化和节省科学家时间的解决方案。”

Inso Bio并不是唯一一家在开发测序仪上游产品中看到机会的公司。伏特实验室和米罗克洛斯有两家公司已经开发了所谓的电润湿技术来自动化和大规模的NGS库准备。vwin德赢ac米兰合作他们有Illumina联合创始人John Stuelpnagel, 23andMe首席执行官Anne Wojcicki和Kapa生物系统联合创始人Paul McEwanCota Capital和Section 32,分别。

捕获长读测序和光学绘图所需的高分子量DNA的技术已经被证明是有价值的。例如,去年8月,PacBio收购了Circulomics具体金额未透露。

虽然Miroculus已经推出了自己的平台,Volta Labs也有望在今年晚些时候推出,但Inso仍在寻求开发一款可销售的产品。”目前,我们正处于寻找新的合作伙伴的阶段”,并进行试点研究,“在我们完成第一款产品之前,弄清楚客户想要什么,他们的痛点是什么,”田说。

Inso与潜在客户签署了四份不具约束力的意向书,与康奈尔大学(Cornell)的研究人员签署了一个试点项目;然而,该试验的重点是基于大小的细胞分离,而不是长读测序样本准备。

田的目标客户是核心设施、临床参考实验室和商业研发设施。“负责排序的是那些人,但他们有能力做出这些购买决定,”他说。

Inso也可能瞄准农业生物领域。田说,该公司的技术可以从“较脏的植物样本”中去除淀粉等次生代谢产物,这使得长读测序更加困难。

在短期内,Inso希望开发一种紧凑的自动化盒子,将长而高质量的DNA直接传递给测序仪。克雷格黑德说:“这仍然是一个桌面研究层面的事情。”“所有这些都必须整合起来,让用户更加友好;我们的目标是让一些事情尽可能不受干涉。”

未来,该公司还可能为光学测绘提供样本准备,比如Bionano Genomics的Saphyr平台,甚至为多组学提供样本准备。田说,这项技术的特点允许它从相同的细胞中捕vwin德赢ac米兰合作获DNA、RNA和蛋白质。

最终,该公司希望与测序平台无缝连接。与Miroculus和Volta一样,Inso Bio的技术也是基于微流体vwin德赢ac米兰合作技术。田教授认为这是未来测序的关键。“我们看到的是,有很多新的试剂盒或方法来进行(测序样本准备),但很少采用微流体格式。”

此外,“在未来几年,短阅读技术将越来越难脱颖而出。”“我认为必须有更多的垂直整合,才能真正做到差异化,一个单一的系统可以在一个封闭的系统中采集样本、处理它们、测序并分析它们,”他说。“我们认为自己有这种潜力。”

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