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Nature Papers on Goal of Human Pangenome Reference Consortium, Cycas Panzhihuaensis Genome,更多

人类泛基因组参考联盟是一个旨在建立反映人类多样性的参考基因组的国际研究人员联盟,制定任务自然这个星期。在这篇文章中,该联盟成员强调了现有的人类参考基因组缺乏多样性——目前是20多人合并的单倍型的线性组合,一个人组成了大部分序列——并指出需要“更复杂、更完整的人类参考基因组,用基于图形的端粒到端粒的全球基因组多样性表示”。该组织表示,为了实现这一目标,它将与世界各地的科学家和生物伦理学家合作,创建一个代表人类基因组多样性的人类泛基因组参考和资源。它还将努力改进装配技术,开发一个工具生态系统,用于分析基于图形的基因组序列。vwin德赢ac米兰合作他们说,这样的资源将“包含更准确和多样化的全球基因组变异代表,改善基因疾病在人群中的关联研究,将基因组研究的范围扩大到基因组中最重复和多态的区域,并作为未来生物医学研究和精准医疗的终极遗传资源。”

参考基因组铁树panzhihuaensis它是现存种子植物最古老谱系之一的成员,也是这类植物最后一个缺乏高质量基因组组合的主要谱系提出了自然植物本周.由中国科学院的科学家们领导的团队建造的组装,“弥合了我们对种子植物基因组结构和进化的理解中的一个重要鸿沟”,并使比较成为可能基因组学和系统基因组分析可以帮助“解开苏铁和其他裸子植物重要性状的遗传控制”。

一项肠道微生物代谢物与结直肠癌(CRC)进展的研究发表在自然的新陈代谢本周,又有新的数据将微生物群与疾病联系起来。虽然已知不同的肠道源细菌可以诱导肿瘤生长,但肠道微生物组与宿主之间与肿瘤细胞代谢的相互作用在很大程度上尚未被探索。为了进行调查,由卢森堡大学的研究人员领导的一个小组使用RNA测序分析了CRC患者和健康个体的粪便样本,发现了高水平的梭菌属nucleatum在癌症患者。进一步的分析表明,这种细菌产生的代谢物甲酸促进了肿瘤的发展。科学家们还确定了CRC表型与梭菌属丰度,并表明用细菌或代谢物治疗小鼠会导致肿瘤发生率或大小增加。

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核酸研究论文介绍了De Novo组装的单细胞测序方法

北京大学的研究人员分享了一种用来自几十个单个细胞的单细胞全基因组序列组装人类基因组的SMOOTH-seq方法。

基因组监测发现隐藏的SARS-CoV-2 Delta变种在新西兰传播

在2021年8月发现一例病例后,追踪SARS-CoV-2传播的努力指向了以前未发现的传播事件。

团队解开替代结束加入功能在果蝇模型

研究人员依靠测序和计算分析来研究Cas9引入的DNA双链断裂的替代末端连接。

携带表达相关snp的非洲人的疟疾风险减弱

在有非洲血统的个体中发现的两个变异与增强的tapasin编码基因表达有关,这为研究人类白细胞抗原i类相关的疟疾风险提供了一个视角。
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