纽约——Viome生命科学公司正在进一步拓展癌症诊断领域，为其CancerDetect唾液测试的关键临床研究做准备。
去年，这家此前以基于微生物的健康产品著称的公司，发表描述其口腔癌的诊断分类-依赖于微生物转录组，或元转录组，剖析NPJ基因组医学目前正计划对该分类器的临床效用进行临床研究。
除了癌症研究之外，Viome还在合作进行其他几项针对各种疾病指征的临床研究，包括糖尿病和肠易激综合征(IBS)。
Viome的首席技术官古鲁都斯•巴纳瓦尔表示，来自消费者健康产品的收入为公司的临床研究提供了资金。vwin德赢ac米兰合作“这一直是我们的愿景——从消费者那里收集数据，进行分析，然后进入治疗和诊断领域，”他说。
去年该公司认为，从消费者那里收集的数据已达到“临界量”，并将其存储和分析在其新品牌ViOS平台上，使其能够开始其业务进军诊断和治疗学研究。
巴纳瓦尔说，在达到这一临界规模后，“我们决定正式为健康科学(业务)创建一个新的业务部门。”
ViOS平台将生物样本(主要是血液、粪便和唾液，尽管Viome已经开始收集其他类型的样本，如脑脊液)与机器学习驱动的metatranscripic分析结合起来，以发现生物标志物，并确定潜在的治疗靶点，以便进一步研究，以及为各种疾病构建预测模型。
Banavar表示，该平台的数据库目前拥有约32.5万个样本，并将以每月约1万个样本的速度增长，所有样本都来自Viome的客户。
其他自我报告的临床数据通常伴随着这些样本，如个人的病史、药物、症状、生活方式习惯和饮食。
巴纳瓦尔估计，大约有20万人购买了Viome基于微生物的健康测试，另有1.1万至1.2万人每月订阅该公司的产品，如补充剂、益生菌和益生元。
Viome没有透露其健康业务去年产生了多少收入，但它也公布了相关数据筹集了5400万美元去年11月获得C轮前期融资，使其总融资额达到1.25亿美元。
Viome因接收而进一步受到鼓舞突破设备名称去年，美国食品和药物管理局批准了该公司的口腔和喉癌早期检测测试CancerDetect。
巴纳瓦尔说:“FDA的突破性认定给了我们信心，我们得到了监管机构和科学界的一些支持，这是值得追求的。”
在Viome最近发表的研究中，该分类器表现出高达83%的敏感性和97.9%的特异性，但该公司需要更强有力的对照研究结果，以获得FDA对CancerDetect的批准，目前该检测是实验室开发的测试。
纽约大学格罗斯曼医学院(NYU Grossman School of Medicine)人口健康教授安志永(Jiyoung Ahn)说，“微生物组对口腔癌变无疑很重要，但要作为癌症诊断和风险评估的工具，这些微生物组应该在严格的研究环境中进行评估，”特别是一项具有多个独立复制的大型前瞻性研究。
Viome正准备在未来几个月内启动一项关键研究，以验证CancerDetect与组织病理学和成像分析相比的有效性。试验将在美国多个地点进行，Viome计划招募“数千名”参与者，不过最终人数仍在与FDA讨论中。巴纳瓦尔说:“我们已经签署了协议，应该很快就会开始招聘。”
虽然Ahn对该公司在评估唾液腺转转录组和癌症之间的联系方面的工作大加赞赏，但她提醒说，在治疗领域，“我们对口腔微生物组是否影响口腔癌患者对癌症治疗的反应的了解非常有限。”
Ahn解释说，一个可能使基于微生物组转录反应的治疗方法评估复杂化的因素是，目前还不清楚在治疗过程中微生物组保持多稳定，目前正在进行多种癌症适应症的积极研究。
尽管仍处于早期阶段，Viome也计划使用其metatranscriptomic工具和专业知识，通过与其他药物开发商合作来追求癌症治疗。
Banavar说:“我们现在正在进行下一步的药物开发。”他补充说，Viome计划在ViOS分析的基础上制造铅分子。
一旦该公司有了临床前的候选人，它计划寻找临床试验的合作伙伴。
除了癌症，Viome正在研究IBD的几个潜在治疗靶点，这些靶点来自人类和微生物组的基因特征，不过Banavar说，现在对结果发表评论还为时过早。
＂O我们的ViOS平台已经实现了一种快速的方式——仅仅几个月——在人类宿主方面，在微生物组方面，以及宿主和微生物之间的相互作用方面，识别IBD的新靶点。”
该公司还与Advent Health合作开展其他未披露的代谢疾病的临床研究，并与梅奥诊所(Mayo Clinic)合作开展肥胖和失眠的临床研究。
Banavar说:“我们与Advent Health的介入代谢研究是一项包括数百名参与者的适应性研究。”“这些方案已经得到IRB的批准，我们很快就会开始招募这些患者。”
他补充说，Advent Health的其他研究正在计划中，梅奥诊所的研究仍在设计中。
尽管转向诊断和治疗，Viome仍然致力于发展其个性化营养项目。
该公司最近出版了预印本BioRxiv该公司利用ViOS的粪便和血液样本数据，为肠易易综合征、2型糖尿病、抑郁症和焦虑症患者提供个性化的饮食建议。
Viome目前有大约150名员工，预计在未来一两年将扩大一倍。该公司位于西雅图和纽约市，其生物制药业务主要位于西雅图，计算生物学业务主要在纽约。巴纳瓦尔表示，他预计近期的大部分招聘将集中在西雅图。