纽约-自今年早些时候COVID-19大流行开始以来，数千项临床试验已经启动，以更好地了解SARS-CoV-2病毒，并寻找成功治疗感染症状的药物。尽管这些研究仍在进行，但医生们正忙于根据有限的、关于安全和有效性的坊间证据，为COVID-19重症患者做出治疗决定。
这种不确定性在一些圈子里引发了一些问题:药物遗传学是否有助于指导治疗决策，或许可以识别哪些人可能对某种药物反应特别好，或者可以标记出哪些患者可能因遗传因素或他们可能服用的其他药物而有发生危及生命的不良事件的风险。
具体来说，由于正在试验的一些最受讨论和争议的治疗COVID-19的药物具有心律失常和猝死的风险，专家认为，PGx检测可能在确定哪些患者已经在基因上倾向于使用所服用的药物发生此类不良事件方面发挥作用。他们说，提前了解这些信息可以帮助医生为COVID-19患者做出更明智的治疗选择，并管理药物，以避免进一步增加这些风险。
对于可能没有明确证据表明药物/基因相互作用的实验性COVID-19治疗模式，专家们希望，正在进行的药物研究(研究人员正在探索生物标志物的作用，如ACE2多态性)将产生更明确的数据。然而，最终，一些人预测，PGx检测的真正用途可能不是帮助指导COVID-19的治疗，而是在随后的精神健康大流行期间作为一种支持工具。
管理风险
Translational Software是一家为将药物遗传学信息整合到患者护理中提供决策支持的公司，在其几个实验室合作伙伴询问之后，该公司最近举办了一场关于PGx检测在COVID-19期间的作用的教育网络研讨会。在会议期间，翻译软件公司首席技术官Houda Hachad讨论了文献中的可用信息、美国食品和药物管理局批准的药物标签，以及关于PGx变体与对正在测试和处方的用于COVID-19的药物(如羟氯喹和氯喹)的反应之间的关系的专家指南。
Hachad强调的潜在应用之一是PGx检测的潜在用途，以避免药物-药物-基因与羟基氯喹的相互作用，羟基氯喹目前已被FDA批准用于治疗疟疾、类风湿性关节炎和狼疮。FDA也授予该药物紧急使用授权，允许其从国家战略储备中使用，用于治疗因COVID-19住院且不能参加临床试验的某些成人和青少年(体重至少50公斤)。
然而，已知这种药物会在已有心血管疾病的患者中引起心律失常，如长QT综合征和尖转，而这些患者感染COVID-19的风险恰好也会增加。本周，美国国家过敏和传染病研究所召集的一个专家小组建议，医生不要将羟基氯喹和抗生素阿奇霉素同时使用——特朗普总统在推特上推广了这一组合——因为这有QTc延长和心脏性猝死的风险。
在一个联合声明在循环美国心脏协会、美国心脏病学会和心律学会也发出了同样的警告。专家小组建议密切监测服用这些药物的患者的心率，如果可能的话，避免其他QTc延长治疗时间。
在她的演讲中，Hachad指出，当评估患者QTc延长的风险时，医生使用一个评分系统，将他们已经在服用的QTc延长药物考虑在内。在这种情况下，PGx检测是有帮助的，通过识别具有某些CYP2C19和CYP2D6基因型的个体，如果他们已经在一长串经常使用的处方药清单上，这些基因型会增加他们发生心脏事件的风险。美国食品药品监督管理局列出了几种药物在其最近发表的“药典关联表”中发现了QTc延长的风险。
根据该表，如果服用抗抑郁药西酞普兰，CYP2C19代谢不良的个体QTc延长的风险比正常代谢者更大。根据专家指南和FDA处方标签信息，CYP2C19代谢不良者应接受较低剂量的药物。
西酞普兰是26th最多的处方药在美国，2017年的剧本数量超过2400万部。如果已经服用这种药物的CYP2C19代谢不良者同时服用羟氯喹，可能会增加他们发生危及生命的心律失常的风险。Hachad表示，在考虑是否使用羟氯喹和阿奇霉素等联合药物治疗COVID-19患者时，PGx信息可以帮助医生更准确地衡量患者QT延长的累积风险。
一个向公众提供信息的应用程序
药物遗传学专家霍华德·麦克劳德(Howard McLeod)在就目前正在试验的治疗COVID-19的药物撰写评论的过程中指出，公众没有地方输入他们正在服用的药物，也没有地方让他们自己了解如果他们感染了病毒并不得不接受实验性治疗，他们可能面临的潜在药物/基因、药物/药物或药物/疾病相互作用的风险。
与此同时，尽管缺乏临床试验以外的证据支持羟氯喹用于COVID-19患者，但羟氯喹的需求却激增。麦克劳德说:“不幸的是，我们看到药店正在开很多羟氯喹的处方。”“其中一些确实近乎不道德的行为。”
在围绕这种药物的宣传和政治活动中，麦克劳德的一位同事想知道是否要使用羟基氯喹作为预防药物，并将这种药物输入到一个名为Pharmazam的药物管理应用程序中。结果显示，由于他已经在服用抗真菌的氟康唑，如果他服用羟氯喹，他将有长QT综合征的风险。
这个例子促使麦克劳德鼓励他担任高级科学顾问的Pharmazam公司推出一个功能，让客户可以了解在大流行期间正在试验的药物的潜在风险。一般来说，Phamazam的应用程序是根据一个人的病史、生活方式、过敏反应以及正在服用的非处方药和处方药来标记潜在的药物/基因、药物/药物或过敏反应。
该应用程序可以免费下载，但要进行PGx测试需要付费，测试必须在clia认证的合作实验室和cap认证的实验室进行，并且必须由医生网络订购(虽然不是个人自己的医生)。McLeod说:“它有药物基因组学，但它也没有忽视患者的其他方面，包括他们的药物、药物/食物相互作用、药物/药物相互作用以及药物/疾病相互作用。”
就应用程序可能标记的在大流行背景下可能感兴趣的PGx相互作用而言，Pharmazam CSO Taimour Langaee强调，ABCC1和SLCO1B1转运体以及G6PD的多态性已知会导致羟氯喹的不良反应。此外，对于抗病毒药物，如利托那韦和洛匹那韦，也在试验治疗COVID-19，有一些转运蛋白，以及CYP450和葡萄糖醛酸化变异，可能会影响反应。
下载并将自己的信息输入Pharmazam应用程序的个人可以控制自己的数据，并可以授予他们的医疗保健提供者查看数据的权限。根据麦克劳德自己的经验，当他最近从应用程序中拿出一份打印出来的药物清单送到医生办公室时，医疗助理很感激，因为他手上有一张方便的药物清单。
另一方面，使用药物基因学来指导治疗选择，在获得主流医学界的接受方面经历了艰难的过程。许多医生拒绝将PGx检测的信息纳入他们的日常工作流程中，除非在非常有限的情况下存在危及生命的不良事件风险。尽管指南和FDA标签支持测试，但医学界对于PGx测试对华法林或氯吡格雷剂量的效用仍有不同的观点。
McLeod承认，医生不愿意采用PGx检测仍然是一个问题，他补充说:“医疗系统需要做好准备，以获得这种应用的全部好处。”
此外，当医生试图在紧急危机中治疗患者时，药物遗传学可能不是最重要的，而且当卫生监管机构对何时检测患者的PGx变体(可能与实验性COVID-19药物存在问题)没有明确的信息时，很可能被忽视。
例如，fda批准的羟氯喹和氯喹的标签表明，G6PD缺乏症患者应谨慎使用这些药物，因为它们可能增加溶血性贫血的风险——在这种情况下，身体分解红细胞的速度比补充红细胞的速度快。然而，FDA的标签并不明确推荐PGx检测。
类似地，当食品和药物管理局发布简报关于羟氯喹的紧急使用授权，该机构指出，溶血性贫血已经在g6pd缺乏的患者中出现，但再次强调，该机构没有提供任何测试指导。
推进研究
“关于G6PD缺乏和羟氯喹，似乎确实存在一些混杂的信息，”phargkb的主任Michelle Whirl-Carrillo指出。phargkb是一个专门整理基因变异在药物反应中作用信息的在线知识库。
pharmacgkb最近推出了一个COVID-19资源试图整理在治疗感染患者时可能涉及到的PGx考虑因素和药物-药物相互作用的现有信息。随着新信息的曝光，该网页正在不断更新，它列出了COVID-19试验中涉及的药物，以及哪些药物在PharmGKB中含有PGx信息，并指出了与长QT综合征相关的药物。还列出了与药物不良事件和代谢有关的基因，以及与允许SARS-CoV-2病毒细胞进入和感染有关的基因。
Whirl-Carrillo说:“这个网页有点像一个移动的目标，因为对COVID-19不同疗法的研究和临床试验的情况变化非常快。”她补充说:“实际上，在这些更新的、更多的实验性药物中，已知的PGx并不多。”“并没有大量的证据表明，基因变异会对患者的预后产生重大影响。”
然而，大流行期间发生的大量药物和基因组学研究为评估遗传学在COVID-19个性化治疗中是否发挥作用提供了机会。pharmacgkb的首席研究员Teri Klein估计，自大流行开始以来的几个月里，有6000多篇与COVID-19相关的同行评审论文发表。
Klein说:“在接下来的一个月左右，我们真的会对其中的一些药物有更好的了解。”他指出，许多实验性药物研究已经迅速登记，并期待相对较快地公布药效和安全性。“在临床试验中，你通常很难找到一个队列，”她说。“不幸的是，在这种情况下，我们不难让人们注册接受这些实验性治疗。”
在Pharmazam的COVID19 PGx项目中，专家们希望更多地了解正在试验的用于治疗COVID-19的药物的药物遗传学，并探索可能使个人更容易感染和出现严重症状的遗传因素。项目中特别感兴趣的是ACE2和TMPRSS2，这两个基因在允许SARS-CoV-2病毒进入细胞并感染细胞中发挥作用。其他研究团队也在研究这些基因，并已经确定了某些ACE2多态性，这似乎使患者更容易感染SARS-CoV-2感染。
更广泛的价值主张
尽管在试图管理COVID-19重症患者时，PGx检测可能不是医生们考虑的首要问题，但药物管理决策支持工具提供商YouScript的前首席执行官Kristine Ashcraft认为，PGx作为一种让患者远离急诊室和医院的工具，其更广泛的价值主张在此次大流行期间尤其相关。
基因检测公司Invitae最近收购了PGx检测公司Genelex及其衍生公司YouScript，但尚未明确在大流行背景下应用这些工具的具体计划。然而，阿什克拉夫特指出，在倾向于从PGx检测中获益最多的人群和那些倾向于面临严重SARS-CoV-2感染风险的人群之间，有一些关键领域是一致的。
老年人往往是药物-基因和药物-药物-基因不良事件的最高风险人群，因为他们更可能对慢性疾病进行多种疗法。与此同时，根据美国疾病控制与预防中心的数据，65岁以上、患有慢性肺部和肾脏疾病、中度至重度哮喘、严重心脏病或肥胖的人更容易因COVID-19而患上重病。
阿什克拉夫特说:“一旦有人感染了COVID-19，除了试图管理病毒感染外，你还要管理他们可能患有的任何其他慢性疾病，确保没有任何药物-药物或药物-基因相互作用就变得更加重要。”
如果大流行期间的目标是让人们远离急诊室和医院，降低感染风险，那么YouScript和其他PGx检测公司进行了许多研究，表明接受检测的患者不太可能因严重不良事件而进急诊室或医院在这里而且在这里）.
阿什克拉夫特说:“我们正在努力做的一件大事就是使曲线变平，这样人们就不会在急诊室或医院呆很长时间。”“无论我们在社区中如何积极主动地更好地管理这种风险，防止人们，特别是非covid -19患者进入可能感染病毒的急诊室或医院，我们的情况就会越好。”
管理精神卫生大流行
虽然研究人员正在努力研发治疗COVID-19的药物和疫苗，让人们对病毒产生免疫力，但也必须控制大流行对精神健康的影响。该领域的专家说，这就是PGx测试最有用的地方。
翻译软件公司的临床药物遗传学内容专家大卫·塞克说:“值得考虑的不仅是PGx在防止住院或改变COVID-19护理过程中的效用，”还包括它可能对管理“COVID-19感染后存活下来的患者的负担……以及那些遭受社会隔离和经济困难的患者的负担”产生的影响。
根据最近的一份《美国医学会杂志》编辑，在二零零三年沙士爆发期间，病人和医生患创伤后压力综合症和心理困扰的人数较多。在2008年受艾克飓风影响的社区中，约5%的人符合重度抑郁症的标准，而在纽约市，十分之一的成年人在9/11之后出现了抑郁症的症状。
“在2019冠状病毒病大流行的背景下，焦虑和抑郁、药物滥用、孤独和家庭暴力似乎将大幅增加;随着学校的关闭，虐待儿童流行的可能性非常大，”波士顿大学公共卫生学院的桑德罗·加利亚、佩雷尔曼医学院的蕾娜·梅切尔特和挪威流行病防范创新联盟的妮可·卢里写道。
一个调查美国精神病学协会的一项调查发现，超过三分之一的受访者表示，疫情严重影响了他们的心理健康，近一半的人说他们害怕感染病毒，62%的人说他们担心自己的亲人会感染病毒。与此同时,拨打药物滥用和心理健康帮助热线从二月到三月增长了八倍。
随着大流行的持续，人们可能会越来越多地求助于药物治疗大流行留下的心理创伤。治疗精神健康问题的药物，包括重度抑郁症，是美国最广泛的处方药之一，但它们也有很大的变数，并与不良副作用有关。
因此，PGx检测的主要应用领域之一是个性化精神病学药物。Myriad Genetics最近在销售GeneSight药物遗传检测发表一项涉及1500多名重度抑郁症患者的元分析，这些患者参与了四项研究，结果显示，接受基于PGx信息的治疗的患者比未接受治疗的患者有明显更好的结果。
尽管PGx在精神病学中的检测并不是没有反对者，但如果在大流行期间或之后精神健康药物的使用增加，医生可能会采用这种检测。专注于精神健康的PGx测试公司genome ind最近采取了一系列措施，使医生在大流行期间更容易提供精神病治疗。医生可以订购genome ind的PGx测试，并将唾液收集套件送到患者家中，然后将其邮寄到实验室进行分析。通过genome ind，医生还可以免费使用Sharecare的符合hipaa的远程医疗平台，直到9月，他们可以使用该平台远程查看患者，并讨论PGx检测结果。
该公司发言人表示:“在COVID-19危机期间，PGx的效用比以往任何时候都更重要。”“这项服务正在帮助实现大流行期间的关键心理健康治疗，而genome ind正在尽最大努力帮助尽可能多的心理健康专业人员。”