由哈佛大学的研究人员领导的一个研究小组发现了结构变异(SVs)，它似乎与儿童高级别胶质瘤的肿瘤发展或临床结果相一致。
高级作者Pratiti Bandopadhayay, Rameen Beroukhim和Keith Ligon是哈佛大学布罗德研究所的研究员，Dana-Farber和他们的同事们说:“这些数据为ssvs对胶质瘤发生的影响和形成它们的机制提供了洞察。写了在自然癌症周一。“我们确定了复发的驱动事件，基于机制信息SV特征对[儿童高级别胶质瘤]进行了分层，并检测了与这些特征相关的遗传事件和临床结果的差异。”
通过全基因组测序，研究人员在179例儿童胶质瘤病例中寻找复发性SV和体细胞拷贝数的变化，发现除了三种肿瘤外，所有肿瘤中的SV都落在或周围已知的癌症相关基因中。他们的结果表明，特定的基因，如MYC或编码受体酪氨酸激酶酶的基因，特别容易受到复发性SVs的影响，尽管发挥作用的精确突变特征取决于儿童高级别胶质瘤亚型的不同。
研究小组注意到，在MYC增强子区域的串联重复在一个子集中被检测到例如弥漫中线胶质瘤(DMGs)。那些MYC增强子扩增在被分析的DMG肿瘤中，有超过10%出现了这种情况。
“MYC增强子放大突出了MYC在[儿童高级别胶质瘤]中未被认识的作用，”作者报告说，并补充说“MYC在[儿童高级别胶质瘤]形成中的作用需要进一步研究。”
研究人员报告说，序列分析还导致了TP53野生型肿瘤以及TP53和其他基因(如CDKN2A和RB1)直接改变的肿瘤中TP53通路的组成部分的反复改变。
野生型TP53的肿瘤往往具有相对简单的突变特征，而TP53、CDKN2A和RB1中的sv似乎出现在肿瘤发展过程的早期，并对应于更复杂的突变特征，以染色体外扩增为标志，在肿瘤进化的后期出现。
研究小组注意到，复杂特征在携带H3.3组蛋白突变的DMG亚型肿瘤和来自半球亚型的儿童高级别胶质瘤肿瘤中过度代表。与所有检测的肿瘤中记录的简单特征相比，无论确定的特定组蛋白改变或TP53突变是否存在，复杂特征对应的总生存时间都更短。
作者指出:“复杂SV特征和存活之间的联系可能是致病的，表明了潜在的治疗靶点，或者它可能代表了潜在因素的可量化的生物标志物，如基因组不稳定。”
更广泛地说，作者建议，当前研究的结果“表明，这些肿瘤的研究和临床测序应该包括整个基因组。”