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Pacific Biosciences计划排序更新,进入新的合作

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纽约 - 太平洋生物科学本周宣布计划进一步改善其排序技术,以及新的和扩大的研究合作。vwin德赢ac米兰合作

具体而言,该公司计划对其续集II和IIE测序套件和软件进行更新。它还将在Boocalling算法和新加坡KK妇女和儿童医院合作的Google Health以及学习神经发作障碍的合作伙伴,并扩大了与Arup Laboratories的现有合作。

新的测序套件“将近一半的前期工作流时间削减,要求客户订购并储存更少的材料,以及更低的DNA输入要求进一步,”首席执行官Christian Henry周二表示,在该公司第四季度财务业绩发布后,与投资者的电话会议。软件升级将在续集IIE上启用直接甲基化检测。

随着PACBIO报告的更新,在2021年,在2021年的“变革”年,与一年前相比,它几乎翻了一口长读测序仪器基础。但是,1月份的早期趋势表明,由于Covid-19和宏观经济状况,利用这些工具的利用率已经放缓,而PACBIO官员颁发Q1和全年2022年的收入指引,低于共识的华尔街估计。

公司的[Q1]和2022年收入指导范围与PACBIO在2021年的表现相比有点令人失望,“Canaccory Analyst Kyle Mikson在投资者的一张笔记中写道。”但是,我们认为现在担任该公司失去了势头,这太早了刚才。“

Scencing升级是在公司推出其版本10.1测序试剂盒之后的一年的4月份提供的,其中包含一种切除DNA输入要求的新聚合酶等。

新试剂盒将降低DNA投入进一步:“我们预期全基因组测序的DNA输入要求将相对于一年前的内容减少,人类全基因组应用中的每SMRT细胞仅为1μg,“亨利说。

亨利说,PacBio还将升级其软件,使所有续集IIE仪器进行型号甲基化检测“,”亨利说。研究人员儿童怜悯医院他说,随着早期访问该特征,已经报道了揭示了诊断为患有这种肌肉营养不良的患者的DMPK基因中的长重复扩展以及高甲基化。“此外,该团队认为,直接和准确地连接具有相同HIFI工作流程的遗传和表观遗传学可能在医学基因组学中具有显着的近期近期适用性。“

合作

亨利补充说,该公司已开始使用Google Health,以代号为基于深度学习的方法来提高原始基础准确性。“随着我们的原始读取准确性的小,我们可以缩短我们的运行时间,提高我们的吞吐量,并允许更大的共识准确性,”他说。

在周三的单独公告中,PACBIO表示它正在合作新加坡的KK妇女和儿童医院研究了未解释的神经发育障碍的遗传原因。

在新加坡计划诊断遗传疾病诊断研究人员将使用HIFI长读取测序来研究其对未解决病例诊断产量的影响。合作伙伴在一份声明中表示,只有39%的这样的案件已经解决了短读测序。

PACBIO还将与KKH合作,以构建针对HIFI长读取测序数据分析优化的生物信息学管道。没有披露合作的财务和其他细节。

该公司还在扩大现有的合作。“例如,ARUP实验室将探讨HIFI全基因组测序作为犹他州奈索项目的一部分,这是一个项目,该项目旨在为新生儿重症监护病房提供患者的遗传诊断,“亨利说。

其他技术

PacBio融入了全能,遵循了8亿美元收购亨利说,去年该公司继续进展。

朝向2021年底,该公司实施了一种新的聚类方法,用于全部的逐个结合化学。亨利说:“我们现在始终观察到Q40级别超过90%的读数超过90%的读数的精致精度,或者每10,000个基地的一个错误。”“该团队正在努力努力将这些进步纳入测试版,我们预期的每流量将输出大于120千兆比兆。”

他补充说,该公司预计将在2022年的下半年与客户提供测试版,并在2023年上半年全球启动序列子。

在问答会议期间,亨利讨论了分析师关于来自Illumina的长读排序市场中的迫在眉睫的竞争问题无限合成长读产品开发中。

缝合共同读取并不是临床测序的解决方案。[他们]只是没有,当你能从本土长读取的更多信息时,无论是我们还是长期读,“亨利说。”如果你能经济上做[这个],没有理由缝合在一起简短的读,“他说。”我认为这对我们的未来产生了重大影响。“

他建议,即使研究人员最初绕过Pacbio的长读产品,他们也可以是“启发”成为客户。“[它]让我们有机会在开始认真的时候卖给这些客户......所以从那个角度来看,它将扩大我们的市场来确定。”

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