纽约——西奈山伊坎医学院领导的一个研究小组建立了一个“患者相似网络”，概述了在数百个个体中发现的多发性骨髓瘤肿瘤所共有和不同的基因组和转录组特征。
“在PSN中，患者被表示为节点，就像在社交网络中一样，根据他们的基因组和转录组信息的相似程度相互联系，”共同资深和共同通信作者Samir Parekh和Alessandro说拉根一个蒂施癌症研究所和伊坎医学院其他部门的癌症、遗传学和基因组学研究人员及其同事解释说。
他们建议他们的新研究发表在科学的进步周三，“证实了使用多种特征来解剖癌症异质性的优势，以及psn处理多种数据类型的能力，以生成清晰和可解释的疾病模型。”
通过全基因组测序、外显子组测序和/或RNA测序，研究人员分析了655名骨髓恶性肿瘤患者肿瘤中的体细胞变异、大小拷贝数变化、染色体易位、基因融合事件和基因表达模式，这些患者均加入了多发性骨髓瘤研究基金会罗盘的研究发现了三种主要的MM亚型和十几个亚组，这些亚组具有不同的特征组合，从易位到染色体1、16和17部分的增加或减少。
“MM的特征是显著的临床和基因组异质性，”作者写道，并补充说，“将MM患者准确地划分为生物学上同质的类别……对诊断、预后和临床管理至关重要。”
研究小组解释说，与基于基因表达的分类相比，除了提供MM亚型更精确的视图外，MM- psn方法发现的集群似乎提供了有信息的预后见解。
研究人员报告说，总体而言，第2组肿瘤患者的无进展期和总生存期比第1组肿瘤患者短。但亚组之间也有预后差异。
他们发现，含有1号染色体增加和4- 14号染色体易位影响MMSET/FGFR3基因的MM患者，其肿瘤的复发率明显更高，例如，与附加染色体增加或仅含有4和14号染色体易位的患者相比，无进展生存期和总生存时间更短。
研究小组通过对559名MM患者的生存分析证实了这些发现和其他发现，这些患者在开始治疗前对其肿瘤进行了分析。他们还发现，1号染色体的单独增加，涉及染色体的第1q臂，在6个MM亚组中出现，往往与复发风险的增加相对应。基于这些和其他结果，他们提出在国际上用于MM的分期系统中包含染色体1q分析。
作者写道:“虽然[1q增益]的预后影响之前已经在许多研究中进行了调查和建立，但我们的网络模型和分析显示，在treatment-naïve名MM患者的风险评估中，这种遗传病变具有更高的意义和中心性。”“目前正在进行的研究集中于MM-PSN亚群的更深层次的特征，特别是那些为增益(1q)而富集的亚群，以获得驱动每种疾病亚型的分子机制的新见解。”