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DIAMONDS项目使用新的分类方法开发快速传染病检测

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纽约——伦敦帝国理工学院的研究人员正在领导一个项目,该项目可能导致多种快速诊断方法的发展,用于检测一系列传染病。

该团队获得了2250欧元(2490万美元)的欧盟地平线2020基金1月该项目名为“利用RNA个性化分子特征诊断对发热性疾病进行诊断和管理”,简称DIAMONDS。vwin德赢ac米兰合作这项研究的技术合作伙伴包括BioMérieux和SkylineDx,以及帝国理工学院的生物医学电子部门。该项目将持续到2024年12月。

据帝国理工学院(Imperial College)儿科和国际儿童健康教授迈克尔·莱文(Michael Levin)说,这项研究的目的是建立一个各种传染病和炎症疾病的遗传标记文库,然后将这些标记转移到一个大约100到150个遗传标记的快速测试中,以便在护理点使用。

他说,这种检测方法不是根据症状来评估病人,然后检测他们是否有特定的疑似细菌或病毒,而是仅通过简单的抽血就可以确定病人的病因。检测的潜在目标疾病可能包括肺炎、结核病、败血症、脑膜炎和其他炎症和免疫疾病。

“我们正在确定一种新的疾病分类方法,”Levin说,他是DIAMONDS项目的首席研究员。莱文说:“到目前为止,疾病是根据体征和症状来分类的。”他说:“这很像一个临床医生在观察病人,并使用标准的实验室血液化学和白细胞计数测试来猜测病人患有什么疾病。”“我们决定,我们可以从第一个血液样本对患者进行分类,并开发出一种新的疾病分子分类法,而不是遵循这种循序渐进的方法进行诊断。”

这种方法还有助于减少广谱抗生素的过度处方,并克服目前检测方法的问题,因为许多临床医生仍然依赖培养,这意味着患者可能需要等待一到两天才能得到具体的诊断。

莱文说:“世界各地有大量的儿童和成人正在接受广谱抗生素的治疗,因为我们没有快速的方法来确定他们是感染了细菌、病毒还是其他疾病。”他补充说,血液培养不仅速度慢,而且不敏感。

莱文说:“目前对疑似感染患者的诊断方法既迟钝又缓慢。”他说:“巨大比例的资源被消耗在试图从一大批病毒感染患者中,从少量细菌感染或其他严重疾病的患者中,找出大海捞针,而这些患者本来可以自行好转。”“无法区分两者的后果是,大量接受抗生素治疗的儿童只是因为我们怀疑或担心他们可能患有细菌感染,而实际上他们可能只是患有病毒感染。”

钻石项目有27个合作伙伴,其中大多数是欧洲的大学和医院,尽管该团队也包括冈比亚、尼泊尔和台湾的机构。与全球各地的合作伙伴联系的部分原因是需要获得足够的样本,为不太常见的疾病开发标记,以及获得更多样化的样本。

莱文说:“开发的任何诊断测试也需要针对非洲和亚洲量身定制。”

莱文在过去15年里领导了许多欧盟资助的项目,这些项目使他和他的团队积累了各种疾病的基因数据,包括结核病和细菌感染。莱文说,这包括大约1万名患者的微阵列或RNA测序数据。对于DIAMONDS项目,研究人员将招募另外5000名患者进行RNA测序。

莱文解释说:“我们希望建立一个欧洲疾病的转录组文库。”“在这个文库中,我们将拥有所有主要疾病类别的基因表达签名,包括细菌、病毒、炎症疾病等。”

在研究人员致力于开发他们的感染和炎症疾病的新分子分类法(他们称之为“个性化分子特征诊断”,简称PMSD)的同时,他们也在与技术合作伙伴合作,这些合作伙伴将把他们的愿景发展为即时检测。vwin德赢ac米兰合作

莱文表示,DIAMONDS项目正在评估几种技术,以便于2023年和2024年在欧洲进行大规模试点研究时使用。其中包括BioMérieux的BioFire FilmArray多重PCR系统和帝国理工学院内部开发的手持平台。总部位于荷兰鹿特丹的分子诊断公司SkylineDx也是合作伙伴,该公司开发了基于阵列和下一代测序的分析。Skyline在项目中的角色将是定义诊断平台的标准,以使用这种方法实现预期的医疗保健结果。

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帝国理工学院的诊断平台被称为Lacewing,由生物医学电子学读者Pantelis Georgiou和他在电气与电子工程系的多学科研究团队开发。这种芯片实验室设备支持实时识别感染,并将数据报告到基于云的网络,从而实现公共卫生监测和流行病学调查。

Lacewing的每次诊断测试都在一个一次性的弹夹中进行,其中目标分析使用集成在硅微芯片上的4000多个化学传感器阵列。核酸扩增实时监测,结果通过蓝牙传输到智能手机上运行的android应用程序,在那里进行存储和处理。

“作为一个团队,我们非常专注于微电子学,制造微芯片,并利用它们创建新的芯片上实验室设备,”Georgiou说。他说:“我们已经证明,我们可以使用离子传感器通过监测DNA扩增过程中质子的释放来检测DNA,与金标准qPCR仪器相比,这是一种快速和负担得起的替代方法。”“使用这种技术,我们证明,我们可以非常可靠地在护理点提供诊断,通过创建一种芯片实验室技术,能够识别血液中的病原体,如疟疾或登革热。”vwin德赢ac米兰合作

与Lacewing合作的Georgiou表示,用户应该能在半小时内得到诊断结果,而该组织在不到7分钟内就完成了识别。除了速度,该集团还希望降低成本。乔治欧表示,他们的目标是12个标记的测试每次约10英镑(13美元)。他说,在英国,相应的实时PCR检测大约需要60英镑。

Georgiou说:“因此,它便宜得多,提供的临床性能与你手掌上的台式仪器相当。”

因为像Levin这样的临床医生对Lacewing有很大的需求,Georgiou说他们想把这项技术发展成一个公司,这样就可以更容易地生产这个平台。vwin德赢ac米兰合作“我们需要一个合适的供应链。这在研究实验室里更难做到。”他说,拉科温最终可能会发展成为一家诊断公司。

虽然DIAMONDSvwin德赢ac米兰合作项目的技术合作伙伴可能会被视为通过试点研究在欧洲医院部署最佳测试,以获得最佳性能,但他说,最终可能会使用多个平台。

“BioFire FilmArray是一个长凳上的仪器,”Georgiou说。他说:“我们的是手持式便携设备。“我们最终可能会发现,这两种诊断方法都有应用的空间。”

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