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在赢得XPrize之后,ChromaCode将目光放在了SARS-CoV-2的测试扩展上

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纽约-过去几周,分子诊断公司ChromaCode一直很忙,先是公布了证实其技术复用能力的数据,然后宣布它是XPrize COVID快速检测大赛的五家赢家之一。vwin德赢ac米兰合作

有了这些新数据和来自竞争的资金,ChromaCode将扩大其产品菜单,并提高其SARS-CoV-2测试的制造能力,超过它已经取得的成就。

ChromaCode的技术vwin德赢ac米兰合作,称为高清PCR (HDPCR)该公司运营和数据科学副总裁克里斯·麦克唐纳称之为“实时聚合酶链反应的升级”。通过使用其专有的化学和数字信号处理,该公司能够在一个反应中包括更多的靶标,在PCR板的一个孔中,而不需要增加新的资本设备。麦克唐纳说,ChromaCode技术令人兴奋的部分是“能够为患者和临床医生vwin德赢ac米兰合作添加更多的数据和更多的答案”。

该技术“vwin德赢ac米兰合作结合了[赛默飞世尔科学的]TaqMan化学和熟悉的工作流程与健壮的编码,在传统qPCR系统上实现更高水平的多路复用,而不增加成本或降低吞吐量,”据介绍一项研究分析化学上月末出版。

研究人员写道,在这项研究中,ChromaCode设计了一种定制的检测方法,在单井中通过5个颜色通道检测20个目标,这需要“仔细设计目标序列”,以避免二次放大,以及“目标放大水平的健壮多通道编码,以适应硬件变化和提高精度”。

研究人员还使用集成DNA技术公司(Integrated DNA Technologies)的常规基因表达序列创建了一种测试,该测试可以使用二进制编码方案在四个颜色通道中检测8个目标,这表明HDPCR技术可以结合单plex TaqMan分析,而无需设计额外的序列。第三次测试在单井中检测到SARS-CoV-2 RNA靶点、流感病毒和呼吸道合胞病毒。

20个靶点的方法的灵敏度超过99%,特异性接近100%,整体井的准确性超过98%,尽管研究人员指出,测试是原型,需要与更多种类的临床样本进行分析。研究人员补充说,SARS-CoV-2原型检测方法的灵敏度为92%。

研究人员说,该技术“使中密度复用与现成的qPCR仪器成为可能,并可应用于任何核酸检测面板,包括常见的诊断面板,如呼吸、血液培养鉴定、胃肠道或抗菌耐药性”。

麦克唐纳补充说,另一个关键的好处是该技术是平台无关的,可以用于任vwin德赢ac米兰合作何qPCR机器。他说:“我们的目标是让任何拥有PCR仪器的人都能成为检测实验室。”ChromaCode的总裁兼创始人Greg Gosch说,虽然它可以在护理点的样本-回答qPCR机器上使用,但该公司认为它主要用于中心实验室,这是该公司的营销努力的重点。

然而,ChromaCode可能希望拓宽其技术,这样它就不会只与现有的PCR平台相关联,华盛顿大学全球卫生、医学和流行病学系的副教授、XPrize的评委保罗·德瑞克(Paul Drain)说。德雷克表示,公司有可能通过额外的投资将其技术扩展到护理点,这将允许它适用于多种环境。vwin德赢ac米兰合作

特里克斯说,这项技术“有可能改变PCR检测的性质vwin德赢ac米兰合作,不仅是针对SARS-CoV-2,还包括其他病原体。”

除了该技术的多路复用能力,Chromavwin德赢ac米兰合作Code还使用符合hipaa标准的云平台进行数据分析和报告测试结果,可以根据需要与客户所需的实验室信息管理系统集成,MacDonald说。

该软件无需实验室人员查看每个样本的数据,而是与该公司的专有化学技术一起在云端进行数据分析。麦克唐纳继续说,实验室可以上传测试的复杂原始数据,并迅速得到完整的报告,而不必自己进行数据分析。

SARS-CoV-2测试

总部位于加利福尼亚州卡尔斯巴德的ChromaCode公司在新冠肺炎大流行的早期阶段就开始了对SARS-CoV-2的检测工作。麦克唐纳说,当封锁开始和美国关闭时,“我们决定全力与该公司合作,制作和生产冠状病毒检测试剂盒,”在8到10周内开发出了该试剂盒。该公司收到紧急使用授权美国食品和药物管理局将于6月对其进行测试。

麦克唐纳说,这项价值25美元的测试可以在两小时内返回结果,同时可以进行380次测试,使得一些网站每天可以处理大约10,000个样本。戈什补充说,仅使用一台仪器,每天的测试总数约为6000次。他说,ChromaCode在过去一年提供了300万次新冠病毒检测。

然而,SARS-CoV-2测试并不是ChromaCode首次进入诊断领域。它之前开发了一种nine-target测试蜱虫传播的病原体和血液测试多药耐药性。

ChromaCode也在寻找其他领域的测试,包括其他传染病、无创产前检测和肿瘤学,Gosch说。

除了用于其SARS-CoV-2检测的EUA外,ChromaCode还能够通过输入XPrize新型冠状病毒快速检测大赛。麦克唐纳说,它最初的条目只是关于其技术和测试如何工作的数据,以及如何分配和扩展vwin德赢ac米兰合作。他说,然后,各支队伍在包含有或没有COVID-19样本的盲法熟练度面板上进行测试,这样评委就可以看到“哪些队伍是真的”。Drain表示,在盲法测试中,该测试“工作流程简单,测试准确性高”。

ChromaCode随后将其测试发送给不同的潜在合作伙伴,如威尔康奈尔研究所,进行临床熟练程度研究,以确保该技术有效且易于使用,他补充说。vwin德赢ac米兰合作Drain说,该测试可以帮助“促进新出现的基因组变异的额外测试,并促进跨PCR平台的测试。”

麦克唐纳说,ChromaCode在加强供应链和制造能力方面付出了"大量努力",使其每周至少能提供50万次检测。他继续说:“我们对下一阶段感到兴奋,我们可以尝试让更多的人使用我们的测试,并开始用它服务更广泛的受众。”500000美元的从XPrize奖麦克唐纳说,这是奖金的第一笔拨款,目前正用于帮助扩大规模。

一旦ChromaCode完成实地研究并向XPrize提供数据,将获得额外的50万美元奖金。麦克唐纳说,这项实地研究需要在部署地点进行为期四周的测试,每天进行500次测试,这样公司就可以从用户那里获得“直接反馈”。

Gosch说,该公司还计划用奖金扩大其SARS-CoV-2检测产品,开发一种将对病毒进行分类和识别毒株的检测方法,以及一种微型呼吸面板,可以通过两个内部控制检测SARS-CoV-2、a /B型流感和呼吸道合胞病毒。他补充说,因为这个迷你面板包含了人类控制,它可以与家庭样本收集兼容,并将在未来几周内提交给FDA进行EUA。Gosch说,ChromaCode还计划将呼吸面板提交给美国以外的监管机构批准。

Gosch说,政府还将探索为那些原本没有全面考试计划的学校和企业提供考试补贴的措施。

疫情加快了该公司的测试开发时间表,使其能够将比预期更多的产品推向市场。它还允许ChromaCode在实验室中实现其产品,而不必亲自到现场,这在两年前是罕见的。麦克唐纳说,由于其技术使vwin德赢ac米兰合作用现有仪器,该公司可以在网络上培训员工,并在一两天内使其技术启动并在实验室运行。

Gosch说:“这项技术的可扩展性是我们成功的真vwin德赢ac米兰合作正原因,因为人们可以收集成千上万的测试,并非常快速地处理它们。”

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