C2i基因组公司已经迈出了计划在全球推出的基于全基因组测序的实体肿瘤微小残留病(MRD)检测测试的第一步，该测试最近获得了CE标志。
该公司及其合作伙伴现在将向认可CE标记的欧洲国家的患者提供C2inform临床检测。这一标签也是卫生当局报销诊断化验费用的先决条件。
C2i表示，早期采用者包括丹麦、瑞士、法国和英国的未公开癌症中心，以及基因组公司OncoDNA战略伙伴关系今年早些时候与C2i合作。
与此同时，C2i首席执行官Asaf Zviran表示，该公司的实验室在美国获得CLIA认证“非常接近”。
为了支持采用，该公司正在发布新的数据，首先是本周在美国癌症研究协会(American Association for Cancer Research)年会上报告的几个临床试验的研究结果。
Zviran说，与实体肿瘤MRD领域的其他研究一样，C2i的目标是为癌症治疗决策提供更好的工具。他说:“尽管我们有很多不同的治疗方法，包括免疫疗法和靶向疗法，但对治疗的诊断和监测基本上可以决定什么时候治疗，什么时候停止，什么时候切换，这些都是用70年代的技术完成的。”
该公司的平台和战略在几个方面与竞争对手不同。首先，C2inform基于全基因组测序数据的分析，使用基于人工智能的模式识别和错误抑制方法开发的患者特异性鉴别器，重组微弱信号，用于对肿瘤相关DNA的高度敏感检测。
相比之下，其他公司的领先技术要么使用固定的表观遗传面板，要么根据初始肿瘤组织测序数据创建定制的、针对患者的分析。
一个最近的预印本出版来自C2i Scientific联合创始人丹·兰道领导的团队，他是威尔·康奈尔医学院的教授和纽约基因组中心的教员，描述了C2inform建立的原始方法的更新。
研究人员报告称，他们改进的分析方法称为MRD-EDGE，与最初的方法相比，提高了WGS中的SNV信噪比富集量300倍MRDetect方法．
根据Zviran的说法，这份学术报告与公司的活动没有直接联系，但它确实反映了C2i在过去几年里对C2inform测试进行的一些商业方面的工作。
另一个区别是C2i的战略，通过传播软件和湿实验室协议提供的模式支持美国以外的测试。
兹维兰说:“我们想把公司建设成让世界各地都能访问的公司。”
由于允许多个实验室进行测序方面的分析需要美国食品和药物管理局的批准，该计划是遵循一个更传统的LDT模式，在一个单一的中心实验室运行。
但对于欧洲的客户，实验室可以在当地对样本进行测序，并通过一个远程分析和报告系统运行公司的测试，该系统位于该公司所谓的C2intelligence云平台中。
这一过程包括对国际合作伙伴实验室的严格培训。兹维兰解释说:“我们正在验证与我们合作的每个实验室，但允许他们基本上在内部进行处理。”“我们实际上是在发送协议。我们正在培训他们，给他们送样品，验证它们，我们正在监控所有湿法实验室过程的质量。”
据该公司称，其分析软件与从任何Illumina NovaSeq仪器接收到的序列兼容。在地面上，测序协议只需要4毫升的血液样本。
C2i首席技术官鲍里斯·奥兰德(Boris Oklander)说:“他们根据自己的地理位置进行测序，不需要处理发送样本的所有监管限制。”vwin德赢ac米兰合作
他补充说:“所有这一切对(前美国)实验室非常有吸引力，对制药公司也是如此，因为临床试验在不同的地理位置进行，以这种方式操作对它们来说超级方便。”
据Oklander说，支持该模型的最关键因素之一是C2i在不同实验室和地理区域的高再现性。在本周的AACR会议上，该公司公布了在自己的实验室和丹麦合作者处理的匹配样本的结果。
调查人员报告称，在97%的样本中，两个实验室的ctDNA状态相同。
研究人员还在AACR上发表了一项研究，表明C2i检测可以在一小群儿童脑瘤患者中检测出MRD。液体活检技术在治疗这些癌症方面一直存在困难，因为血脑屏障会阻止肿瘤DNA分子进入血液循环。
研究结果还处于初步阶段，但使用血液检测来检测和监测这些患者的癌症的能力可能会比目前脑脊液检测方法在临床护理方面有所改善。奥克兰德还认为，这些发现为C2i的高灵敏度提供了进一步的证据。
该公司的下一步工作包括为其纽约实验室获得CLIA认证，发布或展示更多来自欧洲合作伙伴的数据，并支持Zviran所说的多种介入试验，以建立必要的公用事业数据，供支付方报销。
近年来，随着Natera和Guardant Health等公司的商业活动和营销活动的加速，实体肿瘤MRD检测的效用问题正受到越来越多的关注。
一个最近的研究例如，据Natera的肿瘤信息患者特异性Signatera技术的研究报告，在结直肠癌患者肿瘤复发的早期检测方vwin德赢ac米兰合作面，该试验没有附加价值。
然而，Natera和其他公司已经收集了令人信服的数据，支持其他用例，如单时间点或“里程碑”测试，以确定手术或辅助治疗失败的案例。
C2i专注于后者，特别是在两个临床利基领域:癌症患者在新辅助治疗后和手术前的器官保存，以及上述对标准护理手术和辅助治疗后患者的里程碑式检测。
Zviran说，该公司对第一个使用案例的介入研究最初集中在直肠癌和膀胱癌。对于第二种适应症，试验正在探索该检测的泛癌应用，包括最近宣布的与巴黎Gustave Roussy研究所的试验，在该试验中，患者接受手术和任何标准护理辅助治疗，并进行治疗后C2inform检测。
那些被发现mrd阳性的患者被随机分配到升级治疗或持续的护理标准。
兹维兰说:“我们希望能真正地对它的干预能力进行基准测试。”
与靶向组相比，全基因组测序的成本更高。但兹维兰认为，测试的费用是相对于它在节省成本方面的影响而言的。他说:“这就是为什么我们不像其他公司那样，在进行影像学检查前几个月就能检测到疾病的原因，但我们实际上是在向临床决策应用迈进。”
例如，在器官保存方面，通过避免手术，“对患者来说，除了生活质量的改善外，直接节省的成本是巨大的，如果考虑到手术成本、发病率和住院费用，就会超过5万或10万美元，”他说。
MRD社区仍然缺乏与实体肿瘤MRD检测相竞争的直接面对面的比较数据，这就留下了最终优势的问题。但兹维兰暗示，AACR的C2i的一些数据可以间接与其他公司在同一人群中的研究相匹配。
他补充说，一项未具名的制药验证研究也直接将C2i的测试与其他公司的测试进行了比较，但他拒绝详细说明。