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Atila生物系统高通量等温HPV试验在研究中得到验证

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这个故事已经更新,包括来自罗氏诊断公司的评论。

纽约-一项新的研究分子诊断学杂志已经证明,创业公司Atila生物系统公司的HPV检测与罗氏诊断公司的护理标准检测性能相当。该低成本、高通量、多重等温系统在使用福尔马林固定、石蜡包埋的颈部和颈部样本时也表现良好,无需任何核酸提取。

尽管Atila生物系统公司的AmpFire系统被一些著名的团体用于研究环境,如之前报道在美国,由于缺乏已发表的数据,大多数实验室在一定程度上难以评估其有效性。因此,托拉斯Atila的创始人兼首席执行官王友祥表示,该研究是第一份描述该系统及其性能的技术论文,应该会为更多的人接受该系统打开大门。

王说,例如,虽然非洲8个国家的实验室正在使用AmpFire系统进行HPV筛查,而不是凯杰的CareHPV,但其他地方一直在等待同行评审的出版物。

AmpFire HPV使用专利的多重等温核酸扩增化学和实时荧光在单管反应中检测15种高危HPV基因型。该公司的AmpFire仪器可以同时运行94个样本。在最近一份来自非洲使用该系统的地点的报告中,该仪器的成本为1.6万美元,每次测试的成本不到20美元。

托拉斯该测试由一组隶属于美国疾病控制和预防中心、纪念斯隆-凯特琳癌症中心、康奈尔大学威尔医学院、哈肯萨克大学医学院以及西班牙、巴西、加拿大和中国大学的研究人员进行了评估。

根据这项研究,该检测方法的检测限度,通过使用HPV基因型特异性序列克隆的质粒来确定,对于HPV16、HPV18和一些高风险的HPV基因型,每个反应为两个副本,对于其余HR HPV基因型,每个反应为20个副本。

使用214个FFPE标本评估临床样本中AmpFire测定法的性能。

该国际团队还对214个FFPE样本进行了Atila AmpFire HPV检测,并将其与金标准检测、Roche Cobas HPV和线性阵列检测进行了比较。

AmpFire测试对HPV16和HPV18有100%的阳性一致性,对非16/18 HR-HPV有95%的阳性一致性,而对HPV16、HPV18和非16/18 HR-HPV有100%的阴性一致性。

重要的是,53个FFPE临床样本是口咽活检。在美国,70%的口咽癌与HPV相关,新鲜和保存的活检样本经常检测HPV。

目前,美国食品和药物管理局批准的HPV检测旨在用于宫颈癌检测和筛查。

尽管美国病理学家学院和美国临床肿瘤学会引导2018年,新诊断的口咽鳞状细胞癌应确定HPV肿瘤状态,但并未明确指导使用基于pcr的检测。对于口咽癌,目前还没有获得监管部门批准的HPV诊断检测。

具体来说,正如2018年的一份报告所指出的审查关于在食管癌背景下的HPV检测,有许多不同的商用HPV检测,使用不同的检测类型,包括原位杂交和免疫组织化学。

在分子检测方面,商业检测包括BD诊断系统的Onclarity HPV检测,Cervista HPV高危,HPV 16/18检测,Hologic的Aptima HPV检测,以及Abbott RealTime高危HPV检测。还有来自Fujirebio的INNO - LiPA HPV基因分型,以及来自Qiagen的双烯杂交捕获2 (HC2)高危HPV DNA检测和双烯HPV基因分型PS检测。

罗氏公司销售两种HPV检测方法——用于检测高风险HPV基因型的Cobas HPV检测方法和用于进行全面基因型分型的线性阵列检测方法,最常用于流行病学研究之前报道

然而,值得注意的是,分子检测在美国被批准用于宫颈检查。

罗氏诊断公司高级科学事务经理Chris McGowin在一封电子邮件中强调,Cobas 4800系统上的Cobas HPV检测的预期用途是与临床医生收集的宫颈标本一起使用,并对收集设备和保存溶液的种类有非常明确的指示。
尽管如此,“我们支持推进临床验证的HPV检测的努力,让患者和医疗保健专业人员更容易获得它,”McGowin还说。
JCM研究的通讯作者唐毅伟指出,目前用于HPV检测的清除标本类型主要是新鲜的宫颈标本。

Tang在一封电子邮件中说:“由于Atila的抑制耐受能力,它将能够用于其他类型的标本,如FFPE。”此外,该测试的“简单和快速将允许它作为一种实时的护理点测试在现场使用。”

唐在MSKCC期间进行了Atila的评估,但两个月前成为造父变星的中国首席医疗官。尽管目前还没有将这两个系统融合的明确计划,但Tang评论道:“将(Atila的)等温多重放大技术与造父变星的集成滤筒相结合将是一个强大的工具。”

Atila的Wang还指出,使用FFPE样品进行pcr检测需要大量的专业知识、时间和试剂,还可能导致样品丢失。

王说:“用我们的方法,你不需要提取DNA,而是直接培养FFPE样本,两个半小时就能得到结果。”

王说,“发布泵”已经准备就绪,很快就会有更多关于AmpFire的研究出来。他建议,对该系统的研究多达六项,手稿已经提交,应该在今年发表。

Atila总部位于加州山景城,但王雪红在全球有很多关系,包括在中国。

王说,一位专家已经联系过他,这位专家之前评估过AmpFire HPV和无创产前检测,现在在中国疾病控制和预防中心工作。这位专家要求阿提拉开发一种新型冠状病毒2019-nCoV的检测方法,但王拒绝透露其姓名。目前使用的方法需要RNA提取,所以理论上Atila的免提取方法可以节省一些时间。

“我们将提供一个简化的等温分析,不需要提取,希望在数小时内得到结果,”王说。为了尽早发现感染,甚至在症状出现之前,一种高灵敏度和特异性的检测是理想的。他说,Atila本周早些时候开始研究2019-nCoV。

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