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跨谱系GWAS meta分析中发现新的COVID-19遗传风险位点

纽约-通过一项大型全基因组关联研究元分析,COVID-19宿主遗传学计划的成员确定了人类基因组中此前未被重视的11个与SARS-CoV-2感染风险或COVID-19疾病严重程度有关的区域。

“通过扩大COVID-19宿主遗传计划获得的生物学洞察力表明,增加样本量和多样性仍然是一项富有成效的活动,可以更好地了解COVID-19的人类遗传结构,”共同高级和通信作者Andrea Ganna和他的同事说,他是赫尔辛基大学芬兰分子医学研究所、布罗德研究所和马萨诸塞州总医院的研究员写了自然周三。

通过收集近125,600例COVID-19病例的基因分型资料和临床数据,以及通过20多个国家的60项先前研究登记的约250万对照个体,研究人员标记了23个与COVID-19风险或严重程度有全基因组显著关联的基因座,其中包括11个新的基因座。

作者写道:“将基因组研究扩大到包括来自世界各地的参与者,使我们能够测试与covid -19相关的基因变体的影响是否在不同的祖先群体中存在显著差异。”作者指出,“包括SFTPD、MUC5B和ACE2在内的新位点的enes揭示了关于疾病易感性和严重性的令人信服的见解。”

确定的不同风险位点不一定与特定的人口或祖先群体相关。研究小组解释说,相反,基因异质性似乎源于不同研究小组使用的纳入标准的差异,并指出GWAS元分析中包括的大多数研究都是在COVID-19疫苗广泛可用之前进行的。

研究人员指出,他们的分析很好地评估了SARS-CoV-2感染的总体情况和COVID-19住院情况,该分析基于125,584名SARS-CoV-2感染者、近260万名对照组和25027名重度或中度COVID-19住院患者的数据,而对照组有280多万名。

另一方面,他们在评估最严重形式的COVID-19(致命或需要在医院进行呼吸支持的病例)的遗传风险方面的权力更小。后一种分析使用了9,376例病例和近3,200个对照的数据。

除了对与其他COVID-19相关特征的潜在遗传关系进行孟德尔随机化分析外,该团队还使用贝叶斯建模方法区分了与COVID-19疾病严重程度相符的16个位点和与SARS-CoV-2感染易感性有关的另外7个位点。

作者解释说:“尽管区分这两种表型具有挑战性,因为这种疾病的严重发展首先需要对感染的易感性,但现在很明显,与这种疾病的这两个方面有关的遗传机制是可以区分的。”

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