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Tempus用新的研究数据集开始精确神经精神病学研究

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芝加哥-美国精神病学协会年会将于周六在新奥尔良召开,Tempus公布了一项研究和精确医学计划,将现实世界的分子和临床数据应用于神经精神病学和其他精神健康服务。

在这个名为Tempus N+的项目中,总部位于芝加哥的生物信息学和分子实验室公司将与其学术医学中心网络合作,收集、策划、构建和协调大量数据,以建立多模式研究管道。该公司希望Tempus N+能够打破数据孤岛,促进更全面的精神病学研究,就像它过去对癌症所做的一样,现在正试图在病理学上做。

根据CSO Joel Dudley的说法,N代表神经精神病学。

在这项新计划中,该公司希望与美国各地的学术医疗中心合作,为先进的心理健康研究创建一个可持续的基础设施。在该公司的愿景中,用户将能够在一个安全的环境中贡献真实世界的基因型和表型数据,以帮助建立一个多模态、纵向数据集,比目前的选项更全面。

Dudley说:“从一开始,向研究人员开放(我们的)关键数据就一直是Tempus的使命。“为什么现在是神经心理学?”基本上是因为我们刚刚开始获得临界量的数据。”

这种策略对该公司及其客户来说并不陌生。

颞部进入病理市场今年3月,他们推出了Edge平台,该平台为病理学家提供了在线访问人工智能模型的机会,通过单个苏木素和伊红染色的幻灯片来识别具有潜在重要生物标志物的样本。该平台旨在帮助医生决定是否订购可能表明有资格进行靶向治疗和临床试验的基因组测序。

在推出Edge的同时,Tempus还宣布了NAPA,这是一个计划中的全美病理学实验室网络,为改进公司的人工智能模型贡献数据,目标同样是为靶向治疗和临床试验识别患者。NAPA类似于Tempus综合分子评价(TIME)试验这是一个有3年历史的网络,为癌症患者提供类似的服务。

对于N+, Tempus将依靠其核心肿瘤学平台的经验,从其nP全外显子组药物基因组测试,以及从与电子健康记录集成系统

“我认为它真的遵循了我们在肿瘤学领域采取的模式,”Dudley说,因为N+还试图从临床试验中生成和组织大规模数据。“然后,如果我们有大规模的数据,就会有一些利益相关方受益,”即临床医生和研究人员。

Dudley将nP描述为多模态测试,因为Tempus通过全外显子组测序收集分子数据,并将实验室结果与表型数据相结合。他说:“它们已经在世界上被收集,并被注入到这种(N+)资源中。”

然而,早期的程序和N+之间有一些重要的区别。

Dudley说,精确的神经精神病学必须严重依赖患者报告的结果数据,这主要是因为没有像癌症那样描述疾病进展的标准方法。他解释说:“这就是为什么用我们收集的其他(患者报告的)数据来丰富我们得到的临床数据是非常重要的,这反过来应该提供表型和数据流,以一种单靠临床数据无法做到的方式为研究提供动力。”

Tempus必须在其核心信息平台上建立一个新的技术栈,以支持这vwin德赢ac米兰合作些数据,这些数据将输入到N+和神经精神病学特定分析中。达德利说:“现在我们已经用我们的数百名工程师为我们自己做了规模扩展,我们真的想把这项技术开放给神经病学或神经精神病学研究人员,因为他们根本没有这种类型的技术,即使在研究领域也没有。”vwin德赢ac米兰合作

该公司还通过人工和人工智能驱动的自动化流程组合来管理数据。Dudley说:“组织和构建数据,然后跨机构、EHR系统和不同类型的疾病地区将其规范化,这是多么巨大的工作量啊。”德赢ac米兰区域

为此,Tempus开发了一些工具,供用户查询分子和表型数据,以确定患者队列,以回答特定的研究问题。“这些并不是我们销售的真正工具。这些只是技术堆栈之上的增值工具。”vwin德赢ac米兰合作

即使是Tempus雇佣的大量网络工程师、数据科学家和计算生物学家也不足以挖掘公司正在收集的所有数据。达德利说:“我们没有足够的人来提出所有重要的问题,我们可以通过这些数据来解决这些疾病的问题,所以我们需要让其他人对这些数据提出问题。”

鉴于N+是一个全新的项目,Tempus还没有与有意参与的机构签订任何合同,尽管该公司在心理健康领域已经有了几年的雄心,特别是药物基因组学驱动的抑郁症筛查.新项目增加了PGx筛查本身没有提供的研究元素。

Dudley表示,Tempus将向任何类型的转化研究开放N+数据集和技术平台,从药物发现到一线治疗。vwin德赢ac米兰合作尽管该公司最终可能会欢迎一些制药公司作为合作伙伴,但Dudley表示,最初的营销努力将集中在学术研究人员身上。

Dudley说,神经精神病学的一个挑战是,目前定义精神疾病的方法——《精神疾病诊断与统计手册》第五版(DSM 5)——“相当陈旧”,因为它比精确医学所承诺的更静态,更少颗粒。

达德利说:“我们还没有神经心理学方面的数据来真正开始思考如何……我们如何建立一个精神疾病的精确医学本体论或疾病分类学。”“希望这个数据集能够支持这一点。”

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