纽约——一项新的分析发现，基于多个祖先群体数据的多基因风险评分可以改善所有人群的炎症性肠病预测。
根据美国疾病控制与预防中心的数据，炎症性肠病——包括克罗恩病和溃疡性结肠炎——影响着美国约300万人。虽然全基因组关联研究已经确定了200多个与IBD相关的基因座，但许多研究关注的是欧洲血统的个体，并表明在一个祖先群体中形成的多基因风险评分在其他群体中可能表现不佳。
利用西奈山伊坎医学院BioMe生物银行收集的数据，研究人员比较了利用欧洲人、非裔美国人和德系犹太人病例对照研究以及利用这些研究组合开发的PRS开发的IBD多基因风险评分。正如他们所报道的周四的日记胃肠病学他们发现，综合数据得出的风险评分改善了对所有人群的预测。
西奈山查尔斯·布朗夫曼个性化医学研究所的资深作者朱迪·赵在一份声明中说:“准确预测不同祖先个体的遗传疾病风险的能力是一个可能对患者预后产生积极影响的关键途径，因为早期干预甚至预防措施正在被考虑和开发。”“这些发现支持了对更多基因多样性的需求，包括更多关于非裔美国人的数据，以增强疾病风险预测，减少所有人群的健康差异。”
对于每个祖先群体，研究人员使用BioMe生物银行的数据生成并应用了一个PRS。该数据集包括32,595个被认为代表纽约市地区人口的个体，在本研究中，包括339例IBD病例和19,202例对照。本队列中IBD的患病率与预期的疾病患病率估计数一致。
然后，研究人员评估了PRS预测疾病状态的能力。总体而言，非犹太裔欧洲人的预测效果最好，而非裔美国人的预测效果较差。
当他们评估从三个祖先队列的元分析中生成的风险分数时，分数的预测能力提高了。在非犹太欧洲血统的队列和德系犹太人队列中，改善比非裔美国人队列更显著。研究人员指出，这种非裔美国人预测能力的下降可能源于参照数据集的缩小和非洲裔人口中遗传多样性的增加。他们补充说，这些发现强调了对非裔美国人和非欧洲人进行更多研究的必要性。
此外，他们还研究了与非常早发性IBD相关的罕见变异在三个祖先队列中对疾病的贡献。对于欧洲血统的个体，他们证实了IL10RA变体在IBD中的作用，并注意到LRBA的两种变体与非裔美国患者IBD的关联趋势。
LRBA变异不仅导致LRBA蛋白表达降低，还导致细胞毒性T淋巴细胞相关蛋白4 (CTLA-4)蛋白水平降低。LRBA是一种跨膜蛋白，在囊泡运输中起作用，LRBA的改变已被发现影响CTLA-4到细胞表面的循环，并影响自身免疫炎症。
由于疟疾药物氯喹已被证明可以增加CTLA-4的表达，研究人员建议，未来的研究可以帮助预测哪些IBD患者可能从氯喹或类似药物中受益。“由于LRBA和CTLA-4表达降低会导致IBD，氯喹能够部分恢复表达，这是令人鼓舞的，”西奈山医学院博士后、第一作者凯尔·盖特勒在一份声明中说。