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宿主DNA甲基化签名可以预测持续性,解决MRSA感染的可能性

纽约 - DNA甲基化签名可能能够区分抗持久性甲氧胞蛋白的患者葡萄球菌金黄色葡萄球菌一项新的研究发现,从那些MRSA感染分解的人感染。

持续的MRSA感染,即使具有适当的治疗,感染不能清除的感染可能会发生高达30%的MRSA病例,并且危及生命。这包括用抗生素治疗,即孤立似乎对此敏感一世n体外,建议可能存在有助于感染持久性的因素的相互作用。

在以前发现他们和MRSA治疗成果的DNA甲基化酶之间发现联系,由加利福尼亚大学洛杉矶的Elaine Reed在有治疗的人之间进行DNA甲基化模式的DNA甲基化模式的差异那些没有的人。他们报道于此国家科学院的诉讼程序在星期一甲基化签名的差异与特异性免疫细胞基因有关,并且可能用于引导治疗。

“结果表明,特定免疫细胞中的DNA甲基化外膜型可用于评估和预测感染的第一个感染迹象的持久性结果的可能性,”芦苇和她的同事Michael Yeaman,同样在UCLA中写着电子邮件。“如果是这样,预测此类结果可能会引导先发制人,个性化的治疗方案,以防止持久性和改善结果。”

研究人员招募了一个有匹配的142人队列,其中大约一半持久地拥有MRSA,其中一半是有解决的MRSA。如预期的那样,具有持续性感染的个体具有更高的死亡率,更长的医院住院,以及增加的转移性风险。

它们通过减少效果亚硫酸氢盐测序从患者收集外周血液以进行全局甲基化分析,并基于DNA甲基化水平的分类模型的近750,000个CPG位点。他们发现276个宿主CpG位点的甲基化水平与持续或已解决的感染显着相关。特别地,160个差异甲基化位点是如下甲基化的,并且在持续的MRSA与分辨MRSA中的116个高甲基化。

基于这些集群,研究人员开发了一个分类模型。进一步的分析表明,DNA甲基化谱可以有助于确定或甚至预测持续的MRSA。

研究人员鉴定的一些差异甲基化的位点仅在转录开始点下游或超过50千碱基,并且在转录因子结合位点中富集。它们特别注意到CCAAT增强剂结合蛋白-β(C /ENPβ)的结合位点中的低甲基化以及持续疾病患者的转录1(Stat1)的信号传感器/活化剂。同时,解决感染患者的低甲基化大部分聚焦在糖皮质激素受体和组氨酸乙酰转移酶P300结合位点上。他们注意到这些甲基化鉴定在中性粒细胞中特别富集。

研究人员通过靶向甲基化位点和它们未覆盖的区域进行了靶向亚硫酸氢盐测序进行了验证。它们另外分析了这些位点的遗传序列,以发现表观遗传学而不是遗传学似乎摇摆患者反应。

研究人员提出的研究结果表明,其甲基化签名可用于临床中,以便快速确定哪些患者可能更容易具有持久性MRSA感染。“在简单的情况下,我们的研究结果让我们更接近个性化诊断和有效治疗危及生命的感染,”芦苇和她的同事说。

他们添加了他们现在进行前瞻性试验,以验证这些DNA甲基化签发是否可以从解决MRSA菌血症中预测持续的MRSA。此外,他们正在检查这些甲基化签名是否存在于其他感染中。

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