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猛犸生物科学公司在darpa资助的病原体检测技术开发中发挥主导作用

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纽约——猛犸生物科学公司在美国政府资助、公私合作的一项基于CRISPR基因编辑技术的多病原体检测平台的开发中发挥了领导作用,展示了该公司的CRISPR酶检测和工程技术能力,并强调了传染病诊断方法的普遍灵活性。vwin德赢ac米兰合作

这个项目,由美国国防高级研究计划局(DARPA) 3670万美元的合同资助“用基因编辑技术检测它”(DIGET)项目旨在创建一种一次性的点护理设备,用于检测至少10种病原体,以及一种用于检测至少1000个目标的大型多路复用设备。

合同研究机构MRIGlobal将作为主承包商,其他参与组织将作为分包商,提供非常具体的任务清单。Mammoth将作为主要分包商之一,联合创始人兼首席技术官Janice Chen将与MRIGlobal的Richard Winegar和Julie Luvwin德赢ac米兰合作cas一起作为联合首席研究员领导团队该公司基于crispr的DETECTR疾病检测平台将用于帮助开发该项目的技术。vwin德赢ac米兰合作

DARPA启动了DIGET项目在2019年底建立诊断和生物监测系统,以跟上疾病暴发的步伐,并在需要的时间和地点支持决策,同时利用基因编辑技术的进步。

DARPA表示,根据该合同创建的即时诊断设备和大规模多路复用设备都必须操作简单、成本低、可快速重构。一次性护理点设备还需要提高分诊和治疗的速度和效果,并提高在恶劣环境中的军事和公共卫生领域的护理标准。

至于多路设备,该机构正在寻找一种能够早期发现威胁、评估疾病严重程度并提高态势感知能力的诊断设备。该平台还必须为生物监测工作提供可操作的数据,例如描述已知和紧急病原体的特征,以便为部署对抗措施提供信息。

其中一个威胁是SARS-CoV-2。尽管陈不能自由透露合作伙伴为小组考虑的所有目标,但她证实,目前正在引起大流行的病毒将是小组的一部分。研究人员还在考虑最近出现的不同的SARS-CoV-2变种,它们似乎更具传染性,到目前为止,事实证明追踪起来很困难

“事实是,我们已经发现了这些变异,我们仍在试图了解其临床意义。我认为这不是我们最后一次听到这种病毒或其他病毒出现新的变种。”“这就是DARPA在设计合同和项目目标方面真正具有前瞻性的地方,这是真正利用设计新的CRISPR探针的灵活性,例如,能够处理这些新出现的威胁,能够……快速编程新的CRISPR检测酶来处理这些新的变体和新的突变。”

事实上,CRISPR的可编程性是许多研究人员和公司转向这项技术的原因vwin德赢ac米兰合作2020年建立新冠病毒诊断技术开发平台.在这种情况下,陈说,它将允许研究人员快速设计新的指南,以寻找新的变种,无论是出于诊断目的还是生物监测。

研究人员还希望创建一个平台,可以在新的、可能引起大流行的病毒出现时迅速部署。陈指出,DARPA的目标之一是开发一个完整的管道,从新目标识别一直到测试开发。

“该项目的一部分实际上是为硅工具的开发提供资金。你可以把它想象成CRISPR软件,你可以尝试设计新的指南来追踪新的疾病目标或新的传染病病原体,”她说。“我们的目标是在24小时内,你实际上能够配置一个能够在这些平台上运行的测试。”

还有其他几个合作伙伴参与其中,他们的参与对该项目的工作至关重要。Mammoth负责CRISPR化学,新型CRISPR检测酶,以及指南的设计,以及帮助设计超低成本,一次性格式设备。Draper、IDbyDNA、加州大学旧金山分校和Toolbox Medical Innovations都贡献了他们的技术和专业知识。vwin德赢ac米兰合作

具体来说,Draper——一家多学科工程和科学公司——主要负责设计大规模多路复用设备,Chen说,“所以看看你可以用CRISPR做什么。”

加州大学旧金山分校的研究人员将负责识别不同的生物标记物,这些标记物表明了由面板上的病原体所带来的疾病的严重程度。Chen指出,他们将为CRISPR指南的靶点选择的临床意义提供输入。事实上,Mammoth和UCSF对彼此在这一领域的能力非常熟悉。2020年4月,加州大学旧金山分校的查尔斯·邱和陈共同开发了基于crispr的SARS-CoV-2诊断方法可以在30到45分钟内进行,具有与qRT-PCR测试相同的敏感性和特异性。

IDbyDNA在自己的声明中表示,它将为该项目贡献其病原体数据库和算法。陈还表示,该公司将帮助开发软件和算法,以解释来自大型多路复用设备的数据。

她说:“正如你可以想象的那样,观察目标检测的水平,能够提取关键信息,真正获得决策信息是非常重要的。”

工具箱将在项目的后期阶段发挥作用,管理临床研究,以寻求监管机构对该设备的批准。

现在还处于项目时间表的早期阶段,所以现在还不能确定将采用何种形式的即时检测,例如,研究人员将使用哪种CRISPR酶。陈说,基于纸的妊娠检测是一个简单、用户友好的测试的好例子,它被多次引用为将基于crispr的测试推广到家庭的最佳方法,但尽管基于横向流的测试在廉价、易于操作和可部署方面满足了关键需求,但与金标准的分子检测相比,它们在性能上也存在缺陷。

她指出,目标将是修改CRISPR以适应这种格式,同时仍然提供高灵敏度和特异性。

同样,研究人员还没有决定要使用哪种酶。猛犸拥有几个独家许可证从加州大学伯克利分校的独特酶,如Cas14而且中科院ɸ但陈说,DARPA合同的一部分还包括开发全新的酶。

她还指出,投资创新将是帮助Mammoth及其合作伙伴实现项目目标的重要一步。她说:“我们已经有了很多内部工具,但我们也想把它推进到下一个水平,能够识别甚至更好的检测酶。”

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