患者血VWIN娱乐网站液样本的表观遗传分析可能有助于诊断SARS-COV-2感染并预测疾病的严重程度，称预印迹新研究。感染在主机中留下了特定的DNA甲基化签名，在发现背后写了科学家，可用于为Covid-19诊断和预后提供见解。
使用基于PCR的技术进行的传统Covid-19测试提供了诊断信息但不是预后信息。然而，表观遗传测试有可能诊断患者，诊断它们，并帮助临床医生管理患者护理，COLICADO（CCPM）和高级作者Colorado中心主任Kathleen Barnes表示预印纸。
“疾病存在或不存在甲基化模式之间的关系可能与其他诊断平台一样提供信息，并且我们想象这可以扩大规模以解决大流行，”巴恩斯说。她和她的团队发现，与机器学习技术结合，DNA甲基化分析可以鉴定SARS-COV-2特异性表观遗传签名。
"We’ve been able to demonstrate high sensitivity and specificity in predicting an infection, and also in-hospital clinical deterioration,” said Barnes. “Our findings suggest that measuring methylation signatures during and after SARS-CoV-2 infection can provide clinicians with the ability to detect viral infection, as well as predict that patient’s clinical course.”
Barnes表示，她开发并领导CCPM“解散有助于健康差异的遗传支持。”该中心的目标之一是将广泛的电子医疗记录与多孔信息联系起来，以加速发现，将改善人类健康和改变医学的实施方式。为此，CCPM在科罗拉多大学与Uchealth合作建立了CLIA和CAP-Certified Biobank。
在大流行之前，CCPM团队与Illumina合作，探索将基于肿瘤分类和诊断的基于临床甲基化的测试的选择和探讨CCPM Biobank。当Covid-19 Pandemer开始时，这次Biobank允许Barnes和她的同事继续他们的研究努力，同时寻找战斗SARS-COV-2病毒的方法。在当天停工开始，Barnes读了一篇关于Covid-19的表观遗传学的文章，立即改变了她的研究，专注于甲基化和传染病。
“有一个疯狂的争夺从Covid患者获得生物学，”巴恩斯说，这不是本研究的最大挑战之一是获得样品。通过Biobank推动的合作，团队理论为其可以使用血液样本来实现其目的。获取血液表明比捕获剩余的鼻咽样本更容易。该团队还具有可靠的健康数据仓库，可以跟踪对Covid-19测试样品捐赠者是否测试了样品捐赠者，如果是，它们是否对病毒是阳性的或阴性的。
作为经验丰富的Illumina微阵列用户，Barnes的团队通过定制甲基化型珠芯片试剂盒开始其Covid-19研究，这使得研究人员在单核苷酸分辨率下以全核苷酸的850,000个位点调查甲基化。
为定制套件，Barnes和她的团队增加了大约7,800个额外的CPG网站，代表他们认为的基因不仅适用于Covid-19感染，而且对于一般的传染病而言。它们称为得到的珠芯箱“史诗+”。
“即使已经有很多工作要学习传染病，我们觉得甲虫尚未充分利用，”巴恩斯说，“......使用史诗+珠芯片的甲基化量化实际上是非常实惠的。”这种定制的珠子使SAR-COV-2的差异宿主DNA甲基化模式的分类使得她认为她希望能够在临床环境中提供诊断和预后。
Barnes表示，中共的下一步是在整个Biobank种群中使用整个Biobank种群的史诗+芯片，寻找传染病的额外预后和诊断症状。“我们认为这是一种可行和小说的，我们已经有了现有的GWAS数据，”她说。“我们一直在讨论我们如何在肿瘤学的空间内将甲基化化物实施到我们的临床生物汉中，但现在我们正在考虑更大。”
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可提供甲基化珠米诺嘧啶的细节这里。
使用这项工作的进一步细节，采访了Kathleen Barnes这里。