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Agendia BluePrint试验在乳腺癌亚型提炼中的新数据支持作用

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纽约-最新发布的数据显示,由Agendia公司的BluePrint基因表达测定所确定的分子分类可能与基于其他已建立的乳腺癌生物标志物的预期有显著差异,这可能会改变肿瘤学家治疗特定患者的方式。

在本月初美国临床肿瘤学会虚拟年会上的海报展示中,研究人员展示了两项关于BluePrint分类模式的新研究。该公司强调了这两项测试,说明了该测试的分子分类如何揭示乳腺癌的侵袭性或对治疗的反应性,而不是从HER2和ER生物标志物状态等传统因素中收集到的不同信息。

在一份公布数据的声明中,该公司认为,这些发现“在诊断和治疗计划过程的早期为医生和患者提供了即时的、可操作的信息,并建立在将影响未来乳腺癌治疗和结果的研究基础上”。

Agendia的首席医疗官William Audeh本周表示,BluePrint的分子分类界限与HER- ER和pr为基础的命名并不完全匹配,这一事实已经明确了一段时间,考虑到测试技术,这是有道理的。vwin德赢ac米兰合作

“从大局来看,我们用BluePrint研究的是基因的表达,”Audeh说。基于80个基因阵列的检测,根据下游信号通路的基因表达,将乳腺肿瘤分为腔型(A或B)、HER2或基底型。

Audeh认为,由于这种途径的活性实际上是驱动肿瘤行为的因素,BluePrint的研究结果更接近“乳腺癌的基本生物学”,而不是在细胞表面受体蛋白水平上进行分析。

因此,他说:“我们发现,当你观察乳腺癌中的这些功能基因表达模式时,它们并不总是与我们从免疫组化分类中所期望的肿瘤相关。”

Audeh补充说,随着BluePrint在更大范围内的临床应用,揭示这些不一致性的含义以及它们如何为临床决策提供信息的工作正在进行中,这项工作不仅产生了新的ASCO数据,还产生了先前的补充发现和潜在的新发现。

在ASCO的一项研究中,与Agendia合作的研究人员评估了使用2018年ASCO/CAP指南确定的HER2状态与BluePrint确定的分子亚型之间的一致性,并对1453个样本的真实诊断队列进行了评估。

2018年,ASCO和美国病理学家学会更新了他们的HER2 IHC/ISH分类指南,以减少HER2不明确病例的频率,对这些病例的治疗建议一直不明确。

根据海报作者的说法,之前使用BluePrint进行的研究表明,在之前的指南中被确定为HER2模棱两可或HER2阳性的肿瘤中,有相当一部分没有被分子分析归类为HER2亚型。因此,考虑到更新的HER2-IHC分类截止点,他们试图衡量同样的情况是否属实。

该团队写道,根据2018年指南建议建立HER2阳性肯定会导致他们的队列中总体上HER2模棱两可的肿瘤减少,“证实了修订的积极影响。”但被BluePrint归类为“非her2”亚型的her2阳性肿瘤的数量仍然显著。

根据BluePrint的数据,在整个队列中,69%的最终HER2阳性肿瘤和所有HER2模棱两可的肿瘤都表现为非HER2。该试验将99例her2阳性肿瘤中的17例重新分类为腔内A型,99例中的40例为腔内B型,99例中的11例为基底型。

虽然ASCO的海报没有直接处理这个问题,但Audeh说,例如,以前的数据是存在的来自NBRST试验结果表明,这些IHC HER2/BluePrint非HER2肿瘤可能对HER2定向治疗有次优反应。在Agendia对NBRST数据的研究中,与同样为HER2型的HER2肿瘤相比,BluePrint认为管腔型的HER2肿瘤的病理完全缓解率显著降低。

就临床相关性而言,Audeh认为,该数据加上来自ASCO的BluePrint重分类的新证据表明,如果肿瘤学家在决定是否应用新辅助治疗寻求病理完全缓解时,他们对BluePrint-luminal her2阳性癌症的缓解预期应该低得多。

他说:“在这种情况下,一些患者和他们的医生可能会选择直接进行手术,而不是等待,看看他们是否属于极少数可能得到(病理完全缓解)的人。”“然而,真正的her2阳性在任何类型的乳腺癌中都有最高的缓解率,护理标准确实是肯定会让他们接受新辅助治疗,除了最小的肿瘤。”

匹兹堡大学医学院医学教授、该研究的PI Adam Brufsky在一份声明中说,尽管这些发现可能没有直接的相关性,但它们“在某些时候可能会影响治疗决策和患者的结果”。

Audeh说,为了更明确地证明这种关联,Agendia现在正试图分析来自大型临床试验的外部队列,使用Agendia的MammaPrint预后测定法和BluePrint,以更好地确定是否可以预测HER-2靶向治疗和可能的联合化疗的反应性。

他补充说:“我们认为BluePrint将帮助我们……我们正在寻求这些数据,以确定它是否有助于以更精确的方式指导治疗。”

第二项ASCO研究也将BluePrint分类模式与传统生物标志物确定的乳腺癌名称进行了比较,但在这种情况下,它分析了BluePrint确定的基底样状态与所谓的三阴性状态(HER2、ER和PR阴性的癌症)的分布。

该公司表示,根据BluePrint数据与遗留生物标志物状态的对比,这项分析的发现可能对患者的治疗可能或应该如何改变有更直接的影响。

该研究分析了一项名为FLEX的大型正在进行的注册试验招募的小队列,该试验旨在招募至少1万名18岁或以上的组织学证实为侵袭性I-III期乳腺癌患者,使用Agendia的MammaPrint预后检测方法进行检测,有或没有BluePrint分型。

ASCO的FLEX海报评估了一组143个自我报告的患者种族(高加索人、非洲裔美国人和拉丁美洲人)的基因组基础型癌症中三阴性乳腺癌亚型的分布,并显示,总体而言,这些基础肿瘤是异质性的,包括所有定义的TNBC亚型,与种族无关。

此外,研究人员观察了基础型队列中IHC决定的雌激素受体状态的患病率,发现该组中大约三分之一的BluePrint基础型肿瘤经IHC检测为ER+。

根据研究人员的说法,这表明肿瘤学家基于他们的ER状态可能认为是Luminal型的肿瘤的一个子集实际上是基础型的。

与第一项研究的结果类似,Audeh说,这种基础肿瘤、腔内肿瘤、三阴性肿瘤和er阳性肿瘤分布的复杂性是Agendia之前观察到的。他说:“我们早就知道,当你研究三阴性乳腺癌的基因组学时,它们并不都是基础的。”“有一部分人似乎有其他活跃的途径。反过来也是对的,一些被证明是基因基础的肿瘤并不总是三阴性。”

Audeh补充说,这项分析最重要的方面是,它增加了对这一独特的雌激素阳性癌症子集的认识,这些癌症原来是基因组基础的。

“它们的表现与大多数雌激素阳性乳腺癌非常不同,”他说。“它们对化疗更加敏感,基本上表现得和其他基底癌或大多数三阴性乳腺癌一样。我认为这在临床上是非常重要的,因为许多肿瘤学家对待三阴性乳腺癌的方式与对待雌激素阳性乳腺癌的方式截然不同。”

埃默里圣约瑟夫医院(Emory St. Joseph's Hospital)的乳房外科主任、海报作者之一凯茜·格雷厄姆(Cathy Graham)在一份与这些数据一起发布的声明中说,Blueprint有可能重新分类ER+肿瘤的子集,这一证据“确定了一种紧急且可采取行动的情况”。

她说:“从临床角度来看,当这些患者首次被诊断时,他们似乎患有腔内乳腺癌。”“但是(通过全面的基因组检测),这些乳腺癌中的很大一部分被重新归类为高风险的基础型。”她指出,这表明这些知识可以让肿瘤学家制定更个性化的治疗方法。

Audeh说,NBRST的研究也获得了这方面的数据,表明BluePrint确定了“一组隐藏在雌激素阳性人群中的患者,但具有更高的化疗敏感性和更高的侵略性。”

Audeh说,在该试验中,er阳性和her2阴性但经BluePrint检查结果为基础的肿瘤组,其病理完全缓解率要比雌激素阳性的肿瘤高得多,而雌激素阳性的肿瘤最终被证明是腔内的,差异非常显著。在Luminal B癌中,尽管雌激素受体呈阳性,但被认为是高风险的,病理完全缓解仅为6%左右。Audeh说,相比之下,er阳性的基底肿瘤反应率约为34%,与三阴性的反应率相似。

Audeh补充说,临床医生处理三阴性的方式可能与他们不知道肿瘤属于这一类或其BluePrint等价的基础型子集的方式有很大不同。

他说:“当我问肿瘤学家,他们是否会对雌激素阳性癌症和三阴性癌症给予相同的化疗方案时,很多情况下他们会说不。”“他们倾向于使用三种或四种药物方案或含有蒽环类药物的积极方案来治疗三阴性。他们倾向于在er阳性癌症中使用两种药物方案。”

“我们也知道,除了最小的肿瘤外,三阴性乳腺癌通常以新辅助化疗作为治疗标准,”Audeh补充说。“有数据表明,如果你推迟辅助治疗超过8周,结果开始变得更糟,所以你不想推迟治疗。但对于er阳性的癌症来说,情况就不一样了,开始化疗的时间可以在一定程度上推迟,而不会产生有害的结果。”

如果Agendia能够进一步证实这些发现,那么对乳腺肿瘤专家来说,这一发现预示着一个潜在复杂的未来,在HER2-、ER-和pr亚型的治疗决策方面,现有的实践可能需要根据进一步的分子分类增加细分和重新评估,但Audeh认为,更大的个性化只会使患者受益。

他没有提供BluePrint的详细采用数字,但他表示,该公司采用的是与MammaPrint检测方法相当的方法,目前大约90%的样品都被发送到该公司,其中包括同时进行两种检测的请求。

“我们真的认为,总产量……真正提供了人们现在可以得到的最全面的早期乳腺癌基因组分析。”“我们在这些海报中发现了什么……在接下来的更多数据中…这种基因组多样性具有临床意义。”

他总结道:“下一步是找到适用于我们正在发现的亚型的最佳疗法。”

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