纽约——中国分子诊断公司AnchorDx计划开发一种价值100美元的循环肿瘤DNA (ctDNA)筛查测试，用于在早期阶段检测六种主要癌症类型。该公司的目标是，一旦获得美国和中国监管部门的批准，就在这两个国家推出该测试。
上周，在美国癌症研究协会年会的第二届虚拟会议上，该公司公布了极光检测技术，该技术可以捕获并分析血浆中的甲基化ctDNA，用于多种癌症筛查。该公司已经在肺癌、乳腺癌和结直肠癌中评估了这种检测方法，并计划在胃癌、食道癌和肝癌中进一步研究。据该公司展示的一张海报显示，在中国，这些类型的癌症占新诊断癌症病例的60%以上，占癌症相关死亡病例的70%以上。
根据研究结果，AnchorDx团队已经在中国提交了专利申请，并计划在美国提交PCT专利申请。
“Aurora是一种高效、完整的检测方法，每次检测的成本为100美元(约)，是可控的，这对基于人群的癌症早期筛查至关重要，”AnchorDx在其海报上说。
该公司的技术开发副总裁Kevin Chen表示，该公司的目标是开发实用和可访问的癌症诊断测试，包括癌症筛查、癌症反射测试和伴生诊断。vwin德赢ac米兰合作锚dx于2015年由原Illumina高级总监、首席执行官范建兵创立，总部位于中国南方的广州。2019年6月，公司与Ilumina为中国市场开发临床肿瘤检测，并在加利福尼亚州弗里蒙特开设了美国分公司。
在2017年,AnchorDx在B轮融资中筹得2800万美元目前仍在使用这笔资金，以及从A/A+轮获得的1,000万美元。此次融资来自北极光、六维、建新资本、马拉松、药明康德、金医药和Arch Venture。Chen表示，AnchorDx目前正在寻求第三轮融资，但没有透露具体金额。
极光测试使用一个小型的DNA甲基化面板，跟踪100到200个甲基化生物标记物，以确定六种主要癌症类型的早期阶段——肺癌、乳腺癌、结直肠癌、胃癌、食道癌和肝癌。Chen说，只使用几百个生物标记有助于节省检测成本，避免过拟合，并仍然保持良好的总体性能，而使用1000个甚至10000个不同的标记则很容易对诊断模型进行过拟合。
为了开发Aurora, AnchorDx团队使用了公共数据库，如癌症基因组图谱(TCGA)，但主要是他们自己的内部数据库，该数据库保存了来自早期癌症患者和正常对照组的2000多个组织和4000多个血浆样本的全基因组甲基化分析数据。
为了测试Aurora，研究团队使用了246份来自肺癌、乳腺癌和结直肠癌患者的血浆样本，以及来自中国六个临床地点的141份正常对照和19份肺良性结节样本。为了区分恶性和正常样本，利用随机森林建模来获得分类器，该分类器对大肠癌的灵敏度为55%，对乳腺癌的灵敏度为63%，对I期肺癌的灵敏度为82%，预定义的特异性为99%。
Chen称，极光检测比其他癌症筛查检测具有更好的特异性和敏感性，因为它有许多早期癌症样本可供生物标志物发现，而且AnchorDx已将新的生物标志物添加到其数据库中。他说:“我们想找到早期癌症的特定标记，而不是公共数据库中非常丰富的晚期癌症。”“这就是为什么我们建立了自己的数据库。”
为了进行测试，首先从血浆中提取ctDNA，然后进行亚硫酸氢盐处理。在此之后，100到200个DNA甲基化生物标记被捕获并转化为序列库，然后在Illumina MiSeq系统上进行测序。
Chen说:“Aurora拥有一个包含许多早期癌症特异性标记物的小得多的面板，这为多癌或泛癌筛查提供了一个健壮、准确和低成本的测试。”他说:“因为(我们的)面板很紧凑，目标尺寸很小，大约100到200个，我们可以使用相当低的测序深度来捕获信号，然后我们可以使用Illumina MiSeq平台进行测试。”
作为比较，Guardant Health的月球试验，例如，在ctDNA中寻找DNA甲基化和其他信号，用于早期癌症检测。同样，Grail已经开发了一种甲基化测序血液测试，用于早期发现多种癌症。Nucleix公司的EpiCheck试验也是基于液体活检样本的DNA甲基化谱。
陈说，极光测试的周转时间是几天，但加上样本的运输和测序，整个过程可能需要一周到10天。他补充说，与其他早期癌症检测测试和AnchorDx有经验的多组学测试相比，Aurora测试更快。
该测试也可能有益于在体外陈说，因为面板的尺寸小，工作流程精简，健壮，易于操作。该团队正在使用Aurora测试和Illumina MiSeqDx系统创建IVD程序。AnchorDx希望向美国食品和药物管理局提交突破性设备的极光测试申请，并可能在6到9个月内与美国的合作者开始小规模试验。
为了验证在AACR上提出的发现，该团队将完成剩余三种癌症类型(胃癌、食道癌和肝癌)的模型优化，Chen说，并计划将研究扩展到现实临床环境中的一个大型独立验证队列。未来，研究人员还希望极光测试能用于中国以外的各种人群，看看是否有重叠，或者是否能找到新的标记添加到他们的数据库中。在完成这些研究后，陈教授说，该团队可能会公布这些信息，并试图使这种测试在中国和美国商业化。
至于该测试将如何改进其他癌症筛查测试，该团队认为极光测试是标准临床诊断的补充，如用于检测肺结节的低剂量CT。由于低剂量CT经常导致良性结节的不必要治疗，Chen说，极光试验中使用的生物标记物可以帮助区分恶性和良性结节，以防止过度治疗。
目前，AnchorDx在中国市场上有两种实验室开发的检测方法，一种是膀胱癌，一种是肺结节，并计划让这些方法获得FDA的批准，进入美国市场。总的来说，该公司的主要追求是创造一种诊断工具，可以在早期阶段识别多种癌症。
“最终目标是在一次测试中筛选不同的癌症。与此同时，我们只有针对特定癌症的特定筛查工具。”“我们认为，将我们的测试与每种癌症类型的下游临床实践相结合是非常重要的，”他说，每种癌症类型的临床实践是不同的。