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太平洋生物科学公司将推出首个用于COVID-19监测的应用特异性测序试剂盒

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纽约-太平洋生物科学公司本周表示,该公司即将推出一套用于对SARS-CoV-2病毒进行测序的试剂盒和端到端工作流程。

这种特定应用的检测方法将是PacBio的第一个,该公司认为这种类型的产品可以获得更大份额的测序资金,并推动其长期阅读平台的采用。

周二,PacBio首席执行官Christian Henry在公司第三季度财报发布后的电话会议上告诉投资者:“我们加快采用HiFi测序的核心战略之一是开发端到端的整套解决方案,使更多的实验室能够使用PacBio测序,并简化客户工作流程。”他说,实验室,尤其是美国的实验室,已经在使用PacBio的平台来监测COVID-19,但该公司“从美元来看,每个样本的比例非常小,因为我们没有一个成套的解决方案”。

由路易斯维尔大学的梅丽莎·史密斯进行的早期访问实验表明,与PacBio之前与LabCorp开发的基于pcr的协议相比,该试剂盒减少了多达80%的操作时间,同时还消除了样品在板间的转移。“这是一个非常强大的协议,”史密斯说。“当以各种方式汇集在一起时,我们看到了新的试剂盒中更连续的基因组。”

她说:“我们对发射的到来感到兴奋,这样我们就可以得到更多的试剂。”

该试剂盒还减少了试剂使用量和移液量——这是一个重要因素,因为获得某些移液头普遍困难。这些全球供应链问题已经影响到其他测序供应商,也开始对PacBio产生影响。该公司预计,由于供应链相关价格上涨,未来几个季度毛利率将受到1%至2%的负面影响,并预计2022年下半年半导体芯片市场将出现竞争。

其他全球问题也在逼近。亨利说:“美国和中国之间的宏观因素完全不在我们的控制范围内,这可能会让我开始失眠。”“但根据我们控制的情况、我们看到的情况,以及客户使用我们的技术实际做了什么,我们受到了很大的鼓励,我们认为机会仍然在我们面前。”vwin德赢ac米兰合作

我们认为,鉴于潜在的国际和供应链问题,第四季度业绩仍存在很大的不确定性,”Canaccord Genuity分析师Kyle Mikson在致投资者的报告中写道。

Henry还披露了与Coriell研究所合作生产一种新的高分子量DNA参考产品,该产品建立在该公司最近收购的样品制备公司的基础上Circulomics还有一份公司的数据概要协作和儿童慈善研究所合作

亨利说,PacBio第三季度的收入达到创纪录的3490万美元,但COVID-19监测收入“仍在每个季度几百万美元(范围)徘徊”。“所以我不会说这是当季业绩超常的一个重要因素。”

核心业务的增长是主要驱动力,该公司正在打破一年内最多招聘的记录。本季度有九份订单来自PacBio的新客户。该公司还首次提供了哪些应用带来的收入的细分:人类生殖细胞测序约占33%,植物和动物基因组学另外占33%,微生物学和传染病占20%,肿瘤学和新兴应用占14%。

PacBio的HiFi测序,一种通过提取最高质量的循环共识读取来提高准确性的协议,继续发展。该公司已经与谷歌健康和图形处理设备制造商以及人工智能计算公司NVIDIA合作开发了一款能将HiFi读取错误减少40%的软件。

此外,合作者儿童慈善研究所已经完成了600多个HiFi基因组,并发现了先前测序方法未发现的与疾病相关的结构变异、单核苷酸变异和重复扩增。Henry说:“具体来说,HiFi全基因组测序发现的罕见编码结构变异是短读WGS的四倍多,在超过一半的未诊断病例中发现了意义未知的变异和基因。”

但PacBio的官员花了最多的时间谈论他们的新检测试剂盒阵容。

PacBio首席运营官马克·范·欧内说:“我们必须证明这一点。”“为了证明我们可以装备一种产品”,包括样品制备和后端生物信息学。

Van Oene说,COVID-19监测试剂盒的样品准备步骤采用了所谓的分子倒置探针,从而减少了操作时间。如果你把它和汽车列车PCR方法或者市场上的其他方法,你会看到它真正无缝地融入现有的自动化系统,实验室技术人员会欣然接受它。”

他和其他官员表示,他们将在产品发布会上透露更多细节,但补充说,他们也在为Sequel IIe系统准备一个成套的微生物基因组组装应用程序。Henry说:“这次更新使目前的多路复用能力翻倍,同时继续提供业界领先的参考质量微生物基因组标准。”

该公司不会就此止步。基因治疗、CRISPR、合成生物学,甚至RNA亚型测序都是研究人员利用HiFi测序技术探索的应用领域,该公司将紧随其后开发用于这些领域的试剂盒。亨利说:“我们现在可以大规模地做这件事,这使它变得非常有竞争力和引人注目。”我希望我们能围绕这一点开发核心套件,使这些应用程序简单易用,这样世界各地的客户都能使用它们。”

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