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癫痫GWAS导致新的基因位点,潜在的药物靶点

纽约(GenomeWeb)——“国际抗癫痫联盟复杂癫痫”成员的一项新的全基因组关联研究发现了16个常见癫痫的新或已知风险位点,导致了一组候选癫痫基因,其中包括当前的药物靶标。

“发现这些新的癫痫基因为这种疾病的新型治疗提供了重要信息,”共同通讯作者、爱尔兰皇家外科医学院(RCSI)分子与细胞治疗系研究员、未来神经研究中心副主任Gianpiero Cavalleri在一份声明中说。

该团队的GWAS基于15212名癫痫患者和29677名非癫痫患者的阵列基因分型谱,得出了5个过去与癫痫有关的位点,以及11个以前与癫痫发作无关的位点。当研究小组关注由这些风险变异标记的21个疑似癫痫基因时,他们发现钠离子通道、转录因子、突触传递和其他途径涉及的基因过多。

“除了研究结果提供的生物学见解外,这项研究还将鼓励研究人员为困难和复杂的癫痫患者开发个性化和精确的治疗方法,”合著者诺曼·德兰蒂(Norman delantty)在一份声明中说,他是RCSI、futureneuroo和都柏林博蒙特医院的顾问神经学家和研究员。“这将提供更好的癫痫控制,并将提高患者和家庭的生活质量。”

研究人员使用转录组范围的关联研究、表达数量性状位点信息、Hi-C染色质相互作用和其他数据更详细地探索了这些关联。例如,他们发现有迹象表明,很大一部分癫痫风险变异与影响大脑基因表达的组蛋白标记重叠。此外,他们的结果为研究中考虑的癫痫亚型的不同共享和亚型特异性遗传因素提供了线索网上发布昨天在自然通讯

从广义上讲,该团队的“大型分析”中包括的癫痫病例横跨三种疾病类型——局灶性癫痫、遗传性广泛性癫痫和未分类癫痫——以及七种亚型,这些患者来自欧洲、亚洲或非洲裔美国人血统。大多数确定的风险位点显示与疾病的遗传广泛性形式有关,尽管发现了一些额外的关联。

在公开药物基因靶标数据库的帮助下,研究人员发现,目前临床使用的24种抗癫痫药物中,有13种靶向研究中确定的至少一种候选基因。即便如此,他们指出,另外166种药物显示出与GWAS基因的潜在联系,或许为未来的治疗策略提供了一条途径。

“下一步将是在更大的样本中扩大这些结果,然后深入研究特定的患者群体和影响他们癫痫类型的基因,以试验新的治疗方法,”共同通讯作者、墨尔本大学癫痫研究中心主任塞缪尔·伯科维奇在一份声明中说。

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