纽约—通过分析脱氧核糖核酸排序数据与电子健康记录信息相结合,研究人员发现了稀有变异物,这些变异物隐含约20多个基因条件如青光眼和糖尿病。
稀有变异可能对疾病风险产生更大影响,但由于频率不高,研究难度更大宾夕法尼亚大学研究人员使用电子健康记录和DNA排序近11 000人数据逐个分析发现基因型协会
as报文自然医学星期一使用此方法发现26个基因与数类同型,其中一些像PPP1R13L、RGS12和CLIP以前从未与这些条件连接研究者表示,这些及后续发现可使人们深入了解人类疾病生物学
州立大学高级作者Daniel Rader和同僚论文写道, 提供识别稀有基因变异与病型间未探索关系所需的统计权
研究人员搜索宾治生物库10 900名载体稀有预测功能损耗变异,如框架变换插入或删除、停止codon增损或复用网站中断对至少有25位异步运算函数失效变异的基因,研究者随后查看是否存在关联pheno类型总共有97个基因逐个生成全局重要phone类型关联
Pen医学生物库6,432名非裔美国人单组使用Sinai山生物Me生物库、GeisterHealth系统DiscovEHR生物库和UKBiobank数据,研究人员复制了26项结果
5个协会已知并成为基因疾病协会的积极控制类型举例说,自由工联稀有预测功能变异与囊性纤维化大相联,后者是由二元自由工联变异引起的。
其余21个协会是小说PPP1R13L有限预测功能损变RGS12变量与1型糖尿病相关联,CLIP变量与actic Ectasia相关联,这通常与连接组织失序相关联
功能分析进一步支持手头phone类型中某些基因的作用研究者使用Ocle组织数据库发现PP1R13L高度表现为Gloacoma的视觉组织鼠标Glaocoma模型中发现PP1R13L光神经头表达式在晚至中度疾病中最高值,并指出PPP1R13L抑制会加剧视网膜交错细胞死亡-这些细胞受Glaocoma影响最大-同时,在人工多功能干细胞中,研究人员发现氧化性应激上调PPP1R13L表达式
基于这一点,他们得出结论PP1R13L受氧化压力调控并可能防止视网膜交错细胞因glacoma激活和fibrotois而死,PPP1R13Lhaploin
研究组大都来自欧裔 大约20%来自非裔并发现16种稀有预测有害单变异物,这些变异物均非非洲祖先所特有,均未列入GWAS目录或文献中提及。这表明需要更多多研究来加深理解像这些变异可能如何推导疾病