纽约——一项涉及数万名患者的泛癌症分析阐明了肿瘤突变、生存结果和对一系列癌症治疗策略的反应之间新的和已知的关系。
斯坦福大学的研究员James Zou和他的同事说:“这项工作展示了对大量真实世界数据的计算分析如何促进精确肿瘤学，并在癌症中的突变-治疗相互作用和突变-突变相互作用方面产生见解和假设。写了在自然医学周四。
使用基因水平的分析策略，研究人员寻找肿瘤突变概况、癌症治疗史和生存模式之间的联系。他们的数据集包括电子健康记录(EHR)条目和超过40,900名未被识别的癌症患者的数百个癌症相关基因的靶向基础医学面板序列概要，这些癌症患者是Flatiron健康基础医学临床基因组数据库的一部分。
研究小组解释说，参与者包括超过12900名晚期非小细胞肺癌患者，近7900名转移性乳腺癌患者，近3900名卵巢癌患者，约3500名转移性胰腺癌患者，以及数千名晚期膀胱癌、肾细胞癌或黑色素瘤患者，并注意到，该结果是使用了近3900名额外的晚期肺癌、乳腺癌、乳腺癌和乳腺癌患者的数据进行验证的。或结肠直肠癌病例来自美国癌症研究协会数据集。
作者解释说:“对于每个患者，我们有关于肿瘤突变、作为一线或进一步治疗的治疗、现实进展、生存结果的数据，以及从电子病历中提取的人口统计学、肿瘤分期和实验室值的详细信息。”
虽然后续工作也考虑了无进展生存期和治疗中止结果，以及某些突变亚型，但主要分析集中在总体生存期和特定基因突变发生。
在这个过程中，研究小组在接受特定治疗方案的癌症患者中标记了458个与生存有关的明显突变标记，并发现了通常与其他肿瘤改变同时发生的特定突变。
例如，研究人员发现42个基因的突变与至少一种癌症类型的生存结果相关。这些基因依次显示了近100种重要的相互作用。
与过去研究显示的晚期NSCLC中EGFR抑制剂耐药性与KRAS突变之间的关系一致，他们发现用EGFR抑制剂治疗的KRAS突变病例的生存期比通常短，而用EGFR抑制剂治疗的伴有KRAS野生型肿瘤的晚期NSCLC患者的生存期增强。
此外，在癌症和治疗类型中还发现了其他突变与治疗的联系，支持了肿瘤改变、生存和对一系列化疗或免疫检查点免疫疗法的反应之间的已知关系，并为新的潜在预测生物标志物提供了线索。
“总的来说，我们对多种癌症类型、治疗类别和基因的全球分析为潜在的基因-治疗相互作用提供了更全面的图景，”作者报告说，“并为未来的生物学和临床研究产生了新的假设。”
同样地，当研究小组研究基因之间的突变-突变相互作用时，如ALK, BRAF, EGFR, MET, RET, ROS1, ERBB2或PIK3CA，这些基因目前被美国食品和药物管理局批准的治疗靶标，它发现基因或多或少可能发生突变，同时影响目标基因的改变。
作者总结道:“我们的研究结果表明，来自癌症患者的高质量、真实的临床基因组数据可以通过获取患者在不同治疗中的结果信息，成为研究这种突变-治疗相互作用的重要资源。”“随着肿瘤测序数据越来越多地与EHR联系在一起，这种数据结合仔细的计算分析可以极大地造福于精准医疗。”