纽约 - 波士东最近向其肿瘤肖像测试添加了肿瘤微环境亚型，其旨在使用全溢序测序和RNA转录组测序将癌症患者与治疗选择相匹配。
此外，该公司的努力将努力更充分地表征患者的癌症并将其与最佳可用治疗相匹配。
“肿瘤纵向测试是一个综合和整体的测定，含有遗传检测，基因表达和基因签名，肿瘤突变负担（TMB）和PD-L1 RNA表达加PD-L1 [免疫组化]（如果可用）的整合“公司首席医务官Nathan Fowler通过电子邮件表示。
Bostongene现在正在努力通过几种计划和正在进行的临床研究验证该试验。
肿瘤微环境或TME广泛地由环绕和饲喂肿瘤的细胞，分子和血管组成。它在临床结果中发挥着重要作用，并通过施加对肿瘤的影响和抗致瘤效应，通过变化来响应这些行动的改变。
免疫细胞形成一个关键TME组分，可以帮助指导临床医生的免疫检查点抑制剂选择。
“俄亥俄州骑士癌症研究所精神肿瘤学会主管戈登·米尔斯在一封电子邮件中表示，”奥努骑士癌症研究所精密肿瘤主任戈登·米尔斯有多种持续的试验时间，“TME不会影响临床试验之外的护理标准治疗决策。”
Bostongene目前正在测试患有晚期癌症患者的几种单一和双臂研究中的肿瘤肖像测试，尽管在预期初步结果时已经太早说。
测定旨在通过组合基因组和转录组分析来创建TME的更完整的图像。转录组分析的一个可能的优点是能够推断TME中的相对蛋白质量，如这些与mRNA转录物丰富的核心。
通过专有算法的RNA-SEQ数据的去卷积还提供多种免疫细胞类型的相对丰富，包括髓样，基质和内皮细胞和T细胞亚群。
“测试使用DNA全外和RNA转录组测序来检测基因组改变，例如单核苷酸变体，诱导，拷贝数改变，TMB，微卫星不稳定性，表达的融合，[和]越来越多的表达水平。20,000个基因，“福勒说。
与患者的临床历史一起，这提供了有关免疫/治疗响应相关的生物标志物的信息。还有一个先进的测试，提供了额外的分析，包括建议在相关临床试验和肿瘤学治疗建议中的临床实践指南。
Bostongene最近与NEC合作从日本开始提供美国以外的肿瘤肖像测试。
虽然Bostongene称这种基因组和转录组数据组合的分析的关键区分剂，但它并不孤单，旨在从Caris Life Sciences等公司（如Caris Life Sciences）和基因组测试合作）完全肿瘤表征的同类产品中。
Caris'分子智能肿瘤分析测定采用RNA-SEQ，NGS，免疫组化和原位杂交以分析蛋白质，RNA和DNA肿瘤特征。
虽然卡里斯确实研究了TME和已经提出了数据关于独特的肿瘤微环境如何影响癌症演变，公司拒绝评论分子智能测定是否包括分析中的特征。
美国食品和药物管理局等监管机构尚未批准TME作为生物标志物的临床用途，尽管米尔斯等专家认为将TME分析整合到治疗计划中具有重要潜力，但越来越多的研究需要更好地表征tme。
“监测TME将成为治疗的一部分，类似于在未来评估肿瘤的疗法，”米尔斯说。“然而，这可能是在预期临床试验中验证的TME标记的暗示逐渐进程，然后通过FDA批准患者决策中的特定作用。”
部分逐步过程的部分可能涉及长期纵向研究，评估TME如何随时间变化。
斯坦福大学的研究人员Christina Curtis和Kathleen Houlahan伴随着Bostongene的一篇编辑评论，即TME亚型是动态的，在疾病过程中发展和治疗的选择性压力。为此，他们呼吁纵向研究探索TME亚型在这些背景下如何发展。
“虽然Bagaev等人提供了一种框架，以将微环境和基因组特征集成，并且在部署这些和其他工具时，空间异质性和时间动态仍然是重要的考虑因素的框架。”