纽约 — — 宾夕法尼亚大学领导的团队识别了数以百计肾病风险定位器,带入更多子元表达式、基因表达式、单细胞和功能数据以挖掘遗传关联后的一些基因、路径和细胞类型
全面分析人体肾功能并显示子变介法关键作用, 对应作者Katalin Susztak, 宾夕法尼亚大学肾学医学遗传学研究者及其同事写道
面向他们的学习发布方式自然遗传学研究者开始分析公开提供全基因组研究数据 元分析以大约150万个人与肾功能相关变异搜索结果产生750多已知肾病相关变异物和126个过去与肾病无关的风险变异物
团队从那里进行一系列分析,旨在解释肾病相关变异的后果,将近90%风险定位点与目标基因相联并增加表达量化特征轨迹和量化特征轨迹数据
特别是,调查人员集合大型研究eQTL剖面图,如Genotype-Tissu表达项目覆盖686样本的肾eQTL元分析,并按GWAS发现的风险变异
并分析57 200多个单肾细胞单细胞开染色素特征以查看基因型关系、甲基化关系和肾调控特征
作者们指出,综合分析显示脱氧核糖核酸对肾病遗传性的影响与遗传性相关,可追溯到基因表达效果他们还看到某些肾细胞类型、组织或过程增强效果,包括与新陈代谢或细胞死亡相关的路径,以及对肾类小管的影响
调查者还深入到一个轨迹中,研究SLC47A1染色体17上基因内部和前后风险变异理财移植基因肾病分解因果贡献 由全美关联研究组成 近32300名前代英国生物库参赛者分析以及PioMe生物库参与者全局后续关联研究显示SLC47A1稀有功能缺失变异与肾元型相关联,如急性肾衰竭或透析
团队用基因表达式、鼠标模型和其他分析支持这些结果,这些分析突出显示SLC47A1水平变弱或小鼠缺失基因的肾损伤标记和肾病
多行并发证据显示 sLC47A1在肾病开发中因果作用, 作者写道, 显示到目前为止结果显示肾病风险与基因相关