NewYORK-质谱学可用于测量临床细菌样本是否可抗某些抗菌处理并有可能引导处理选择,新研究发现
当前基于文化的方法确定细菌样本是否抗生素可耗时72小时,从而形成时间框架,在此时间段内病人可能用太窄或太广抗生素治疗
为了缩短确定抗微生物抗药性所需时间,巴塞尔大学和瑞士其他地方的研究人员开发了细菌和真菌矩阵辅助激光解吸/离子化飞行时间数据库,或MALDI-TOF、质量光谱剖面图及其关联抗生素剖面as报文自然医学星期一数据库开发分类器高精度预测各种病原体抗菌性回溯临床案例研究进一步显示,约14%的病例中该方法会改变临床处理
eth苏黎世Karsten Borgwardt、BaselAdrianEgli和同僚论文写道
研究者开发数据库,并称数据库抗菌学和MALDI-TOF质谱或DRIAMS收集MALDI-TOF质谱和三万多份来自瑞士四大临床实验室的阻抗信息DRIAMS内最大集合号称为DRIAMS-A号来自Basel大学医院,包括145,341质谱光谱大都可能在24小时内从临床样本中生成
研究人员将DRIAMS-A分解为培训测试数据集并应用三种机器学习方法预测抗菌性重点分析三大临床病原体Staphilococcusa,esherichia大肠杆菌并klebsiella肺炎并用抗生素治疗它们造成的感染
三位研究者都报告总体性能高分类器可预测S.极乐斯抗xacillin80%精度E.西里岛并K.肺炎eftriaxone抗药性目前为2组74%精度所研究的42种抗生素中 31种可正确分类抗生素 精度达80%
研究者指出方法有缺陷在一个站点培训分类器性能不易向其他站点生成质谱转换,原因可能是每个区域有色菌差异,但也是由于技术变异性类似地,分类器预测力优于及时采集样本与训练集使用样本相近,这可能是随时间推移发生类似变化所致。向研究者建议,任何分类程序临床应用者应定期接受新生成本地数据再培训
分类器仍可影响临床使用处理回溯性临床案例研究中,研究人员用正S审查416例极乐斯,E.西里岛并K.肺炎文化圈向63位传染病专家咨询帮助引导抗生素处理研究者对子集案例应用这一方法,以了解分类器是否建议替代处理方式多数54例算法不表示改变,9例算法则表示改变7例变化本会降温抗生素治疗
研究者在论文中写道:“回溯临床案例研究显示,分类者可能对病人治疗产生有益影响并推广抗生素管理”。