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在基因多样化的百万老兵计划GWAS中发现了新的冠状动脉危险位点

纽约-研究人员在百万老兵计划的基因多样性队列中发现了95个与冠状动脉疾病(CAD)风险相关的新位点。

根据美国疾病控制与预防中心(Centers for disease Control and Prevention)的数据,冠心病影响着美国2000多万人,心脏疾病是跨种族和民族人群死亡的主要原因。虽然之前的全基因组关联研究(GWAS)已经确定了208个CAD易感位点,但这些分析主要是基于欧洲祖先群体。在一项新的研究中出现在自然医学周一在美国,由VA Palo Alto Health Care System的研究人员领导的一个团队在更多样化的人群中分析了CAD的遗传风险,发现的风险位点数量增加了近50%。

“总的来说,我们的研究结果强调了迫切需要为非白人人群提供更多的数据,并开发更复杂的分析方法,以消除这种表现差异,并将在临床实践中实施PRSs时加剧现有健康差异的可能性降到最低,”退伍军人医院的Themistocles Assimes和同事在他们的论文中写道。

在他们的分析中,研究人员从非西班牙裔白人的MVP中提取了95151例CAD病例和197287例对照;17,202例CAD病例和59,507例非西班牙裔黑人对照,6,378例病例和24,270例西班牙裔对照。其中90%是男性。

在包含常染色体和X染色体的三个分层GWASs中,研究人员复制了与CAD相关的已知位点。通过合并来自欧洲血统队列的额外数据,CARDIoGRAMplusC4D和英国生物银行在白人MVP参与者中,研究人员发现了33个与CAD相关的基因组意义的新基因座。

同时,一项包括黑人和西班牙裔MVP参与者以及来自日本生物银行的日本参与者的多人群荟萃分析揭示了62个新的基因座,共计95个新的cad链接基因座,其中9个位于X染色体上。

研究人员还对心血管造影确定的CAD负担进行了第二次GWAS,确定了15个全基因组意义的位点,所有这些位点之前都与临床CAD有关。

新的CAD风险位点与至少一种传统的CAD风险因素相关,如高血压、糖尿病或吸烟,研究人员在进一步的全现象关联研究中发现。其他基于基因和途径的分析发现,这些snp不仅涉及CAD生物学的已知方面,还涉及基本的细胞过程,如细胞周期、分裂和复制和生长。

他们的分析还暗示了动脉粥样硬化和肿瘤发生以及癌症生物学之间的联系,因为PheWas的分析表明,大约三分之一的新基因座与癌症或身高有关。他们进一步指出,BRCA1位于他们的一个新基因座内。

不过,研究人员注意到,在黑人或西班牙裔研究参与者中,已确定的CAD易感性位点9p21没有达到全基因组意义。通过检查高危单倍型基因块的祖先起源,他们发现这种基因块在非洲裔人群中基本不存在,而在黑人和西班牙裔参与者中存在这种基因块取决于该基因组区域是否遗传了非非洲裔单倍型基因块。基于此,研究人员指出,9p21区域不太可能在非洲血统比例高的人群中作为风险分层位点。

研究人员还检查了多基因风险评分在MVP队列中预测CAD的效果,发现他们在黑人MVP参与者中表现较差。他们开发的一种新的PRS改进了对人群的风险预测,但并没有缩小他们之间的表现差距。

研究人员写道:“[O]我们的大规模多人群GWAS为CAD的遗传基础提供了重要的新见解,使我们更接近CAD的精确医疗方法,跨越多样性光谱,但需要后续研究来提高CAD的PRSs的可移植性,识别和理解因果基因的机制,并在此基础上开发跨人群和人群特异性的新疗法。”

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